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适用于 Linux 的开放药物发现工具包 (ODDT) 下载

免费下载 Open Drug Discovery Toolkit (ODDT) Linux 应用程序以在 Ubuntu online、Fedora online 或 Debian online 中在线运行

这是名为 Open Drug Discovery Toolkit (ODDT) 的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 ODDT0.7.zip。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。

使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 Open Drug Discovery Toolkit (ODDT) 的应用程序。

请按照以下说明运行此应用程序:

- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。

- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。

- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。

- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。

- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。

- 6. 下载应用程序,安装并运行。

SCREENSHOTS

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开放药物发现工具包 (ODDT)


商品描述

Open Drug Discovery Toolkit (ODDT) 是用于化学信息学、分子建模等的模块化和综合性工具包。ODDT 是用 Python 编写的,并广泛使用 Numpy/Scipy。 您可以使用任何在通用 API 下联合支持的工具包(参考 Pybel 或 Cinfony)。 所有基于 Pybel/Cinfony 的方法和软件都应该与 ODDT 工具包兼容。 与其前身旨在拥有简约 API 相比,ODDT 引入了扩展方法和附加句柄。 这些扩展允许完全使用工具包,并且某些功能可能会从其他功能向后移植以引入缺失的功能。 ODDT 中分子的最重要和最方便的属性是 Numpy 字典,其中包含提供的分子的大多数属性。 其中一些很简单,其他需要一些计算,即。 原子特征。 为分子的主要实体提供了字典。



特性

  • 为主要实体提供字典
  • 主要的好处是奇妙的 Numpy 广播和子集化
  • 每个字典在 Numpy 中定义为一种格式
  • 计算两个分子之间的相互作用并将其存储在指纹中
  • 检查分子之间的相互作用
  • 您可以使用通用 API 下联合的任何受支持的工具包


程式语言

Python


分类

生物信息学

这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/oddt.mirror/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便通过我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。


免费服务器和工作站

下载 Windows 和 Linux 应用程序

Linux 命令

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