这是名为 Splicing Prediction Pipeline 的 Linux 应用程序,其最新版本可以作为 SPiP_alone_v2_1.zip 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
免费下载并在线运行这个名为 Splicing Prediction Pipeline 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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拼接预测流水线
商品描述
SPiP 是一种通过在全局管道中集成多个预测工具来预测变体剪接变化的工具。
/!\ 对于windows版本,所有SPiP分数在修正前2.0和2.1版本之间计算都是错误的,请使用修正后的2.1版本或更高版本。 对于 Linux 版本,SPiP 分数是正确的。
您还可以下载 zip 格式的 SPiP: https://sourceforge.net/projects/splicing-prediction-pipeline/files/SPiP_alone_v2_0.zip
对于 Linux (GitHub): https://github.com/raphaelleman/SPiP
如果您有任何问题,请联系我: [电子邮件保护] or [电子邮件保护]
v2.1 更正 (07/2021):
分数计算修正
v2.1 (06/2021):
最严格的“通过复杂事件改变”
v2.0 (04/2021):
具有随机森林模型的新 SPiP
旧更改详述 https://sourceforge.net/projects/splicing-prediction-pipeline/files/changeLogBeforev2.0.txt
用户界面
Tk
程式语言
S / R
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/splicing-prediction-pipeline/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。