这是名为自动细胞谱系重建的 Windows 应用程序，可通过 Linux 在线在 Windows 中在线运行，其最新版本可以下载为 testData.zip。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
下载并在线运行这个名为自动细胞谱系重建的应用程序，可在 Windows 上在线运行，通过 Linux 在线免费使用 OnWorks。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从本网站启动任何 OS OnWorks 在线模拟器，但更好的 Windows 在线模拟器。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Windows 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序并安装。
- 7. 从您的 Linux 发行版软件存储库下载 Wine。 安装后，您可以双击该应用程序以使用 Wine 运行它们。 您还可以尝试 PlayOnLinux，这是 Wine 上的一个花哨界面，可帮助您安装流行的 Windows 程序和游戏。
Wine 是一种在 Linux 上运行 Windows 软件的方法，但不需要 Windows。 Wine 是一个开源的 Windows 兼容层，可以直接在任何 Linux 桌面上运行 Windows 程序。 本质上，Wine 试图从头开始重新实现足够多的 Windows，以便它可以运行所有这些 Windows 应用程序，而实际上不需要 Windows。
SCREENSHOTS
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自动细胞谱系重建，可在 Windows 中在线运行而不是 Linux 在线
商品描述
来自 Amat 等人，自然方法，2014*：“复杂多细胞生物中细胞谱系的全面重建是发育生物学的中心目标。我们提出了一个开源计算框架，用于高精度和快速地分割和跟踪细胞核。我们通过重建证明了它的 (1) 通用性果蝇、斑马鱼和小鼠胚胎的 2 维 TB 级图像数据中的细胞谱系，使用三种不同类型的荧光显微镜获得，(20,000) 可扩展性，通过分析每个时间点多达 26,000 个细胞的高级发育阶段, 在单个计算机工作站上 1 个细胞 min-3，以及 (97.0) 易于使用，只需调整所有数据集的两个参数，并提供可视化和编辑工具以实现高效的数据管理。我们的方法平均实现了 XNUMX% 的链接准确率跨越所有物种和成像方式。”
*如果您使用此代码进行研究，请引用本文
目的
科学/研究，最终用户/桌面
用户界面
控制台/终端
程式语言
C++，C
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/tgmm/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
