这是名为 kSNP 的 Windows 应用程序，其最新版本可以作为 kSNP4.1-source-code.zip 下载。 它可以在免费的工作站托管提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 kSNP 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从本网站启动任何 OS OnWorks 在线模拟器，但更好的 Windows 在线模拟器。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Windows 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序并安装。
- 7. 从您的 Linux 发行版软件存储库下载 Wine。 安装后，您可以双击该应用程序以使用 Wine 运行它们。 您还可以尝试 PlayOnLinux，这是 Wine 上的一个花哨界面，可帮助您安装流行的 Windows 程序和游戏。
Wine 是一种在 Linux 上运行 Windows 软件的方法，但不需要 Windows。 Wine 是一个开源的 Windows 兼容层，可以直接在任何 Linux 桌面上运行 Windows 程序。 本质上，Wine 试图从头开始重新实现足够多的 Windows，以便它可以运行所有这些 Windows 应用程序，而实际上不需要 Windows。
单核苷酸多态性
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商品描述
kSNP4 识别一组基因组序列中的泛基因组 SNP，并根据这些 SNP 估计系统发育树。 SNP 发现基于 k-mer 分析，不需要多重序列比对或参考基因组的选择，因此 kSNP4 可以将 100 个微生物基因组作为输入。 SNP 位点由围绕中心 SNP 等位基因的长度为 k 的寡核苷酸定义。 kSNP4 可以分析组装重叠群或原始未组装读数中的完整（完成）基因组和未完成基因组。 完成的和未完成的基因组可以一起分析，kSNP 可以自动下载完成的基因组的 Genbank 文件，并将这些文件中的信息合并到 SNP 注释中。
使用 kSNP4 不需要任何编程技能
加德纳，SN 和霍尔，BG 2013。 公共图书馆一号，8(12):e81760.doi:10.1371/journal.pone.0081760
加德纳、SN、T. Slezak 和 BG Hall。 2015 生物信息学 31: 2877-2878 doi: 10.1093/bioinformatics/btv271
分类目录
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/ksnp/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
