这是名为 PBSuite 的 Windows 应用程序,其最新版本可以下载为 PBSuite_15.8.24.tgz。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 PBSuite 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从本网站启动任何 OS OnWorks 在线模拟器,但更好的 Windows 在线模拟器。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Windows 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序并安装。
- 7. 从您的 Linux 发行版软件存储库下载 Wine。 安装后,您可以双击该应用程序以使用 Wine 运行它们。 您还可以尝试 PlayOnLinux,这是 Wine 上的一个花哨界面,可帮助您安装流行的 Windows 程序和游戏。
Wine 是一种在 Linux 上运行 Windows 软件的方法,但不需要 Windows。 Wine 是一个开源的 Windows 兼容层,可以直接在任何 Linux 桌面上运行 Windows 程序。 本质上,Wine 试图从头开始重新实现足够多的 Windows,以便它可以运行所有这些 Windows 应用程序,而实际上不需要 Windows。
SCREENSHOTS
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套件
商品描述
目前,这里托管着由 Adam English 创建和维护的两个项目。
PBJelly - 基因组升级工具。
PBHoney - 结构变异发现工具
两者都包含在下载中的 PBSuite 代码中。
----- PB果冻 -----
阅读论文
http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0047768
PBJelly 是一种高度自动化的管道,可将长测序读取(例如 PacBio RS 读取或 fasta 格式的长 454 读取)与高置信度草图组装对齐。 PBJelly 尽可能多地填充或减少捕获的空白,以生成升级的基因组草图。
----- PB 蜂蜜 -----
阅读论文
http://www.biomedcentral.com/1471-2105/15/180/abstract
PBHoney 是两种变体识别方法的实现,旨在利用长读取(即大于 10,000 bp)的高可映射性。 PBHoney 考虑读内不一致和长读长的软剪尾来识别结构变异。
功能
- 基因组组装
- 基因组升级
- 结构变异
- 装配评估
目的
学术/科研
程式语言
Python
分类
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/pb-jelly/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。