هذا هو الأمر asn2fsa الذي يمكن تشغيله في مزود الاستضافة المجانية OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة على الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
asn2fsa - تحويل بيانات التسلسل البيولوجي من ASN.1 إلى FASTA
موجز
asn2fsa [-] [-A لجنة التنسيق الإدارية] [-D] [-E] [-H] [-L اسم الملف] [-T] [-a نوع] [-b] [-c] [-d مسار]
[-e N] [-f مسار] [-g] [-h اسم الملف] [-i اسم الملف] [-k] [-l] [-m] [-o اسم الملف] [-p مسار]
[-q اسم الملف] [-r] [-s] [-u] [-v اسم الملف] [-x شارع] [-z]
الوصف
asn2fsa يحول بيانات التسلسل البيولوجي من ASN.1 إلى FASTA.
OPTIONS
يتم تضمين ملخص من الخيارات أدناه.
- طباعة رسالة الاستخدام
-A لجنة التنسيق الإدارية الانضمام إلى الجلب
-D استخدم داش للفجوة
-E معرفات التسلسل الممتدة
-H يمتد HTML
-L اسم الملف
ملف تسجيل
-T استخدم الخيوط
-a نوع
نوع الإدخال ASN.1:
a تلقائي (افتراضي)
ض أي
تسلسل الدخول
ب بيوزك
s Bioseq- مجموعة
م تسلسل تقديم
t معالجة الدُفعات (مناسبة للإصدارات الرسمية ؛ نوع محدد للكشف التلقائي)
-b Bioseq-set هي مجموعة ثنائية
-c مجموعة Bioseq مضغوطة
-d مسار
المسار إلى قاعدة بيانات ReadDB
-e N طول الخط (70 بشكل افتراضي ؛ قد يتراوح من 10 إلى 120)
-f مسار
مسار بيانات FASTA المفهرسة
-g قم بتوسيع فجوات دلتا إلى Ns
-h اسم الملف
اسم ملف إخراج ذاكرة التخزين المؤقت للمكون البعيد
-i اسم الملف
ملف إدخال فردي (إدخال قياسي افتراضيًا)
-k الجلب المحلي
-l قفل المكونات مقدما
-m نمط رئيسي للتسلسلات المجزأة القريبة
-o اسم الملف
اسم ملف إخراج النوكليوتيدات
-p مسار
المسار إلى ملفات ASN.1
-q اسم الملف
اسم ملف إخراج نقاط الجودة
-r الجلب عن بعد من NCBI
-s كونتيج الجينوم البعيد للحصول على درجات الجودة
-u يعيد تنفيذ
-v اسم الملف
اسم ملف إخراج البروتين
-x شارع سلسلة فرعية لاختيار الملف (.ent افتراضيًا) [سلسلة]
-z فجوة نقاط جودة الطباعة تصل إلى -1
استخدم asn2fsa عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
