قوس قزح الحيوي - عبر الإنترنت في السحابة

برنامج:

اسم

قوس قزح - صفحة دليل قوس قزح 2.0.4 -[البريد الإلكتروني محمي], [البريد الإلكتروني محمي]>

موجز

قوس قزح [الخيارات]

الوصف

قوس قزح 2.0.4 -- <[البريد الإلكتروني محمي], [البريد الإلكتروني محمي]>

كتلة

تنسيق ملف الإدخال: ملف (ملفات) fasta/fastq المقترن تنسيق ملف الإخراج:
\ ر \ ر \ ر

-1 إدخال ملف fasta/fastq، يدعم عدة "-1"

-2 إدخال ملف fasta/fastq، يدعم عدة '-2' [خالية]

-l
طول القراءة، الافتراضي: 0 متغير

-m
الحد الأقصى لعدم التطابق [4]

-e
عتبة مطابقة تمامًا [2000]

-L مستوى منخفض من تعدد الأشكال

شعبة

تنسيق ملف الإدخال: \ ر \ ر \ ر انتاج |
تنسيق الملف:
\ ر \ ر \ ر [\ر ]

-i ملف الإدخال [ستدين]

-o ملف الإخراج [stdout]

-k
K_allele، المتغيرات الدنيا لإنشاء مجموعة جديدة [2]

-K
K_allele، قم بالقسمة بغض النظر عن التردد عندما يتجاوز عدد المتغيرات هذه القيمة
[50]

-f
التردد، الحد الأدنى للتردد المتغير لإنشاء مجموعة جديدة [0.2]

دمج

تنسيق ملف الإدخال:
\ ر \ ر \ ر [\ر ]

-i إدخال ملف إخراج rbasm [stdin]

-a تجميع الإخراج

-o ملف الإخراج للcontigs المدمجة، سطر واحد لكل مجموعة [stdout]

-N
الحد الأقصى لعدد المجموعات المقسمة للدمج [300]

-l
الحد الأدنى من التداخل عند تجميع قراءتين (صالح فقط عند فتح "-a") [5]

-f
الحد الأدنى لنسبة التشابه عند التجميع (صالح فقط عند فتح "-a")
[0.90]

-r
الحد الأدنى لعدد القراءات المراد تجميعها (صالح فقط عند فتح "-a") [5]

-R
الحد الأقصى لعدد القراءات المراد تجميعها (صالح فقط عند فتح "-a") [300]

الاستخدام: قوس قزح [خيارات]

كتلة

تنسيق ملف الإدخال: ملف (ملفات) fasta/fastq المقترن تنسيق ملف الإخراج:
\ ر \ ر \ ر

-1 إدخال ملف fasta/fastq، يدعم عدة "-1"

-2 إدخال ملف fasta/fastq، يدعم عدة '-2' [خالية]

-l
طول القراءة، الافتراضي: 0 متغير

-m
الحد الأقصى لعدم التطابق [4]

-e
عتبة مطابقة تمامًا [2000]

-L مستوى منخفض من تعدد الأشكال

شعبة

تنسيق ملف الإدخال: \ ر \ ر \ ر انتاج |
تنسيق الملف:
\ ر \ ر \ ر [\ر ]

-i ملف الإدخال [ستدين]

-o ملف الإخراج [stdout]

-k
K_allele، المتغيرات الدنيا لإنشاء مجموعة جديدة [2]

-K
K_allele، قم بالقسمة بغض النظر عن التردد عندما يتجاوز عدد المتغيرات هذه القيمة
[50]

-f
التردد، الحد الأدنى للتردد المتغير لإنشاء مجموعة جديدة [0.2]

دمج

تنسيق ملف الإدخال:
\ ر \ ر \ ر [\ر ]

-i إدخال ملف إخراج rbasm [stdin]

-a تجميع الإخراج

-o ملف الإخراج للcontigs المدمجة، سطر واحد لكل مجموعة [stdout]

-N
الحد الأقصى لعدد المجموعات المقسمة للدمج [300]

-l
الحد الأدنى من التداخل عند تجميع قراءتين (صالح فقط عند فتح "-a") [5]

-f
الحد الأدنى لنسبة التشابه عند التجميع (صالح فقط عند فتح "-a")
[0.90]

-r
الحد الأدنى لعدد القراءات المراد تجميعها (صالح فقط عند فتح "-a") [5]

-R
الحد الأقصى لعدد القراءات المراد تجميعها (صالح فقط عند فتح "-a") [300]

استخدم Bio-Rainbow عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net