هذه هي تغطية الأوامر التي يمكن تشغيلها في مزود الاستضافة المجانية OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة على الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
CoverCount - حساب تغطية القراءات المعينة في كل موقع على وجه العموم
الجينوم المرجعي
الوصف
CoverCount الإصدار 1.5.0-p1
يحسب هذا البرنامج تغطية القراءات المعينة في كل موقع على
الجينوم المرجعي. يقوم بإنشاء ملف ثنائي لكل كروموسوم عن طريق تسلسل
مستويات التغطية كأرقام صحيحة 4 بايت.
الأستعمال
CoverCount [خيارات] -i -o
الحجج المطلوبة:
-i
اسم ملف الإدخال بتنسيق SAM أو BAM.
-o
بادئة ملفات الإخراج. يحتوي كل ملف ناتج على أرقام صحيحة رباعية البايت
وسيطات اختيارية:
- maxMOp الحد الأقصى لعدد عمليات "M" المسموح بها في سلسلة CIGAR.
10 بشكل افتراضي. يتم التعامل مع كل من 'X' و '=' على أنها 'M' ويتم التعامل مع عمليات 'M' المجاورة
مدمجة في سلسلة CIGAR.
CoverCount الإصدار 1.5.0-p1
يحسب هذا البرنامج تغطية القراءات المعينة في كل موقع على
الجينوم المرجعي. يقوم بإنشاء ملف ثنائي لكل كروموسوم عن طريق تسلسل
مستويات التغطية كأرقام صحيحة 4 بايت.
الأستعمال
CoverCount [خيارات] -i -o
الحجج المطلوبة:
-i
اسم ملف الإدخال بتنسيق SAM أو BAM.
-o
بادئة ملفات الإخراج. يحتوي كل ملف ناتج على أرقام صحيحة رباعية البايت
وسيطات اختيارية:
- maxMOp الحد الأقصى لعدد عمليات "M" المسموح بها في سلسلة CIGAR.
10 بشكل افتراضي. يتم التعامل مع كل من 'X' و '=' على أنها 'M' ويتم التعامل مع عمليات 'M' المجاورة
مدمجة في سلسلة CIGAR.
استخدم التغطية احسب على الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
