dcm2mnc - عبر الإنترنت في السحابة

برنامج:

اسم

dcm2mnc - تحويل مجموعات من ملفات DICOM إلى ملف واحد أو أكثر بتنسيق MINC.

موجز

dcm2mnc [ ]

dcm2mnc -مساعدة

الوصف

إنّ كافة أنواع عهود الـ dcm2mnc يتم استخدام الأمر لتحويل ملفات تنسيق DICOM إلى تنسيق MINC.

يتم استخدام تنسيق DICOM (التصوير الرقمي والاتصالات في الطب) من قبل العديد من بائعي
معدات التصوير الطبي كوسيلة قياسية لتبادل البيانات. ديكوم
المواصفات معقدة للغاية وتتضمن بروتوكولات لتبادل البيانات و
الاتصالات وكذلك تفاصيل تنسيق البيانات. في معظم الحالات، عشرات أو حتى
يجب دمج المئات من ملفات DICOM لإنتاج ملف MINC واحد.

في التشغيل العادي، قائمة الإدخال سوف تتكون من أسماء واحد أو أكثر من الملفات أو
الدلائل. يقوم البرنامج بمسح جميع ملفات الإدخال والدلائل المحددة ويحاول القيام بذلك
تحديد مجموعات الملفات التي ينبغي دمجها في ملف MINC واحد. مرة واحدة هذه
يتم تحديد مجموعات (أو "سلسلة") من ملفات DICOM، ويقوم البرنامج بتحليل البيانات الخاصة بكل منها
سلسلة ومحاولات لتحديد الشكل الهندسي الصحيح والمعلومات المساعدة
تم دمجه في ملف MINC.

إذا سارت الأمور على ما يرام، فسيتم إنشاء ملف MINC واحد أو أكثر في دليل فرعي واحد أو أكثر
تم إنشاؤها في الدليل المحدد الإخراج- دير. ستكون هذه الدلائل والملفات
يتم تسميته تلقائيًا وفقًا لاسم المريض وتاريخ الاكتساب والاكتساب
الوقت ومعرف السلسلة والطريقة.

لعدة أسباب، اختارت الشركات المصنعة للتصوير الطبي تنفيذ عدد منها
من ملحقات الملكية إلى تنسيق DICOM. يحاول هذا البرنامج أن يكون عامًا جدًا،
ولكنه يقوم ببعض التحقق الإضافي من حقول الملكية المحددة حيثما يكون ذلك مفيدًا أو ضروريًا.
ومع ذلك، مع تغيير إعدادات الجهاز وتحديث البرامج، تظهر التفاصيل الدقيقة للملف
قد يتغير إخراج DICOM لجهاز معين. أجهزة مختلفة من نفس الشركة المصنعة
قد تنتج مخرجات DICOM مختلفة إلى حد كبير.

OPTIONS

لاحظ أنه يمكن تحديد الخيارات بصيغة مختصرة (طالما أنها فريدة) و
يمكن إعطاؤها في أي مكان على سطر الأوامر.

الناتج ملف الخيارات

-ضرب بقسوة
الكتابة فوق الملفات الموجودة. بشكل افتراضي، dcm2mnc لن يكتب على القائمة
ملف.

-حالا لا تقم بتخزين اسم المريض في ملف MINC. ستكون السلسلة "مجهول".
تستخدم بدلا من ذلك. لاحظ أن جميع معلومات التعريف الأخرى ستظل مخزنة في
الملف.

-nosplitecho
لا تقم بتقسيم الأصداء إلى ملفات منفصلة. في حالة وجود أصداء متعددة في أ
سيتم تخزينها جميعًا في ملف MINC واحد ذي بُعد مسمى
"صدى صوت".

-سبليتديناميكي
تقسيم عمليات الفحص الديناميكية إلى ملفات منفصلة. عادة يتم تخزين عمليات المسح الديناميكية في ملف
ملف MINC واحد ببعد "الوقت". إذا تم تحديد هذا الخيار، في كل مرة
سيتم حفظ الشريحة في ملف منفصل.

-fname
قم بتعيين تنسيق اسم ملف الإخراج. راجع قسم أسماء الملفات للحصول على تفاصيل حول هذا الأمر
الخيار.

-اسم
قم بتعيين تنسيق اسم الدليل الفرعي للإخراج. راجع قسم أسماء الملفات للحصول على التفاصيل
على هذا الخيار. اضبط هذا على السلسلة الفارغة لتجنب إنشاء دليل فرعي.

سيمنز فسيفساء محدد الخيارات

يتحكم هذان الخياران في الطريقة التي يتم بها تحويل بيانات فسيفساء Siemens. سيمنز
عادةً ما تمثل الماسحات الضوئية بيانات الرنين المغناطيسي الوظيفي على أنها "فسيفساء" من الصور الفرعية المدمجة في صورة واحدة
صورة كبيرة. عادة ما تكون هذه في ما نسميه ترتيبًا "تصاعديًا"، ولكن إذا كان وظيفيًا
لم يتم تحويل الصورة بشكل صحيح، فقد تحتاج إلى تحديد أحد هذه الخيارات. لاحظ أن
غالبًا ما لا يكون ترتيب الفسيفساء هو نفس ترتيب الحصول على الشريحة.

- تنازلي
يتم تخزين صورة الفسيفساء بترتيب تنازلي.

-مدخل
يتم تخزين صورة الفسيفساء بترتيب متناوب (فردي/زوجي).

أخرى الخيارات

-ستدين هذا الخيار يقول dcm2mnc لقراءة قائمة ملفات الإدخال من الإدخال القياسي في
بالإضافة إلى أي ملفات محددة في سطر الأوامر.

-كمد
سيقوم هذا الخيار بتطبيق سلسلة الأوامر المحددة على كل ملف إخراج بعد ذلك
مخلوق. يمكن استخدامه لتشغيل gzip أو الضغط على كل ملف إخراج، على سبيل المثال.

-الحد الأدنى - الحد الأقصى

استخدم القيم الخاصة بأكبر وأصغر قيمة بكسل كما تم تخزينها في DICOM
ملف. يعد هذا مفيدًا بشكل خاص مع بيانات GE PET، ولكن قد يكون ضروريًا للحصول على
تحويل دقيق كميا مع الشركات المصنعة الأخرى. إذا لم يكن هذا الخيار
محدد. يستخدم .B dcm2mnc النطاق الكامل لنوع البيانات كما هو محدد بواسطة
عدد البتات المخزنة لكل فوكسل (الحقل رقم 0028,0101). عندما يكون هذا الخيار
المحدد، سيتم استخدام 0028,0106 و0028,0107 لتعيين النطاق الصالح من
بكسل.

-قائمة قائمة الملفات في السلسلة، ولكن لا تقم بإجراء التحويل. مفيدة في بعض الأحيان ل
التحقق من صحة مجموعة البيانات، وتصحيح المشاكل معها dcm2mnc.

-إفراط
عملية مطولة. طباعة كمية كبيرة من المعلومات الإضافية حول
عملية البرنامج. ربما لا يمكن تفسير هذه المعلومات إلا من قبل شخص ما
على دراية بكل من هذا البرنامج ومعيار DICOM.

-ديبوغ عملية مطولة للغاية. يطبع كمية هائلة من المعلومات الإضافية حول
تشغيل البرنامج. ربما لا يمكن تفسير هذه المعلومات إلا من خلال
شخص مطلع على هذا البرنامج ومعيار DICOM.

-استخدام الإحداثيات
يطلب هذا الخيار أن يعتمد التحويل على إحداثيات الشريحة بدلاً من
حقول DICOM القياسية لسمك الشريحة والتباعد. ومن المفيد إذا ل
لسبب ما فإن حقول DICOM القياسية لسمك الشريحة وتباعدها هي
غير صحيح.

-opts
هذا خيار خاص مخصص لأغراض تصحيح الأخطاء فقط. يرجى تجنب الاستخدام
هنا.

عام الخيارات لـ الكل الأوامر

-مساعدة طباعة ملخص لخيارات سطر الأوامر والإحباط

-الإصدار
طباعة إصدارات البرنامج والمكتبة وإلغائها

الملفات

لتجنب تسمية الاصطدامات عند تحويل مجموعة كبيرة من ملفات DICOM المدخلة إلى ملفات أصغر
مجموعة من ملفات الإخراج MINC، dcm2mnc يقوم تلقائيًا بإنشاء أسماء ملفات الإخراج
وفقًا لمعلمات مختلفة لمعلومات ملف DICOM. السلوك الطبيعي هو أن
ضع كافة ملفات الإخراج في دليل فرعي لدليل الإخراج المحدد الذي يحتوي على
اسمها مشتق من اسم المريض وتاريخ ووقت الدراسة كما يلي:

اسم المريض_yyyymmdd_hhmmss/

تتم تسمية الملفات الفردية وفقًا لاسم المريض وتاريخ ووقت الدراسة والسلسلة
المعرف ومعلومات الطريقة على النحو التالي:

اسم المريض_yyyymmdd_hhmmss_series_scan_modality.mnc

تتضمن معلومات المسح الاختيارية رقم الصدى ('e ')، رقم الشريحة ('sl ')،
موضع السلسلة الزمنية ('d ')، رقم المرحلة ('ص ') أو التحول الكيميائي ('c ').

تتكون معلومات الطريقة الاختيارية إما من السلسلة "_pet" أو "_mri". لا
تتم إضافة اللاحقة للطرائق غير المعترف بها.

إنّ كافة أنواع عهود الـ -fname و -اسم تسمح الأوامر للمستخدم بتجاوز تسمية الملفات القياسية
السلوك عن طريق تحديد دليل الإخراج وتنسيقات الملفات البديلة. الحجج ل
هذه الخيارات عبارة عن سلاسل قالبية سيتم توسيعها لتشمل معلومات من الملف
تسلسلات DICOM في مواقع محددة. يتم تحديد الاستبدالات بحرف '%'
متبوعا بحرف أبجدي واحد، على النحو التالي:

%N - اسم المريض
%D - تاريخ الفحص
%T - وقت الفحص
%S - معرف الدراسة (عادة 'yyyymmdd.hhmmss')
%A - معرف الاستحواذ أو السلسلة
%s - تسمية شريحة اختيارية
%e - رقم الصدى الاختياري
%t - رقم المسح الديناميكي الاختياري
%p - رقم المرحلة الاختياري
%c - رقم التحول الكيميائي الاختياري
%m - طريقة اختيارية

وبالتالي يتم توفير اصطلاح اسم الملف الافتراضي بواسطة سلسلة التنسيق:

%N_%D_%T_%A%s%e%t%p%c%m

ويتم إعطاء اسم الدليل الافتراضي بواسطة سلسلة التنسيق:

%N_%D_%T

إذا كنت ترغب في تجنب إنشاء دليل فرعي، فيمكنك القيام بذلك عن طريق إعطاء سلسلة ذات طول صفري
كحجة ل -اسم الخيار:

dcm2mnc -dname ´´ أسماء الملفات...

مؤلفون

بيتر نيلين وريتشارد د. هوج

يرجى توجيه جميع الشكاوى والاستفسارات إلى روبرت فنسنت ([البريد الإلكتروني محمي])

استخدم dcm2mnc عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net