فحش - عبر الإنترنت في السحابة

برنامج:

اسم

Fahash - منشئ التجزئة التسلسلي لـ PCR الإلكتروني العكسي

موجز

فهاش [-hV] -b ملف التجزئة [-w wdsize] [-f الفترة] [-F fragment_min,fragment_max] [-k] [-c
حجم ذاكرة التخزين المؤقت] [-v 1|2] ملف famap ...

فهاش [-hV] -T ملف التجزئة [-o outfile]

الوصف

البرنامج فهاش يعد جزءًا من مجموعة e-PCR ويستخدم لإنشاء ملفات التجزئة والإخراج
إحصائيات استخدام الكلمات لعمليات البحث العكسية لـ PCR الإلكتروني.

OPTIONS

-b ملف تجزئة
بناء جداول التجزئة (ملف التجزئة) من ملفات التسلسل،

-T ملف تجزئة
طباعة إحصائيات استخدام الكلمات لملف التجزئة

-o ملف
كتابة الإخراج إلى ملف "outfile"

خيارات البناء:
-w حجم الكلمة
ضبط حجم الكلمة عند إنشاء جداول التجزئة

-f فترة
ضبط عدم التواصل عند إنشاء جداول التجزئة

-k تخطي التكرارات عند إنشاء ملف التجزئة

-F الحد الأدنى - الحد الأقصى
تعيين علامات مائية لحجم الجزء (بالميجابايت) (الإصدار 1 فقط)

-c حجم ذاكرة التخزين المؤقت
ضبط حجم ذاكرة التخزين المؤقت (الإصدار 2 فقط)

-v ver استخدام إصدار التنسيق (1|2، 2 هو الإصدار الافتراضي)

مثال

famap -tN -b genome.famap org/chr_*.fa

فهاش -ب جينوم.هاش -w 12 -f3 ${PWD}/genome.famap

إعادة PCR -s genome.hash -n1 -g1 ACTATTGATGATGA AGGTAGATGTTTTTT 120-200

يرى com.famap(1) و إعادة pcr(1)

استخدم الفحش عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net