هذا هو الأمر garniere الذي يمكن تشغيله في مزود الاستضافة المجانية OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
غارنييه - يتنبأ بالبنية الثانوية للبروتين باستخدام طريقة GOR
موجز
غارنييه -تسلسل seqall -idc عدد صحيح -ملف تقرير
غارنييه -مساعدة
الوصف
غارنييه هو برنامج سطر أوامر من EMBOSS ("البيولوجيا الجزيئية الأوروبية المفتوحة
مجموعة برامج"). إنه جزء من مجموعة (مجموعات) الأوامر "البروتين: هيكل ثلاثي الأبعاد".
OPTIONS
إدخال قسم
-تسلسل seqall
متقدم قسم
-idc عدد صحيح
في ورقتهم ، ذكر GOR أنه إذا كنت تعرف شيئًا عن الهيكل الثانوي
محتوى البروتين الذي تقوم بتحليله ، يمكنك القيام بعمل أفضل في التنبؤ. "idc" هو ملف
الفهرس في مجموعة من المصفوفات ، dharr [] و dsarr [] ، والتي توفر "ثوابت القرار"
(dch ، dcs) ، وهي إزاحات يتم تطبيقها على أوزان اللولب والورقة
(تمديد) الشروط. لذلك ، تقول idc = 0 لا تستخدم تعويضات القرار الثابتة ، و idc = 1 إلى 6
يشير إلى أنه يجب استخدام مجموعات مختلفة من إزاحات dch و dcs.
الناتج قسم
-ملف تقرير
استخدم Garniere عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
