هذا هو الأمر gbrowse_import_ucsc_db الذي يمكن تشغيله في موفر الاستضافة المجاني OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
Browse_import_ucsc_db - يقوم بإنشاء مصدر بيانات إطار العمل
الوصف
يؤدي هذا إلى إنشاء مصدر بيانات إطاري لأحد الجينومات المعروفة لجينوم UCSC
المتصفح. يمكنك بعد ذلك تعديل ملف تكوين مصدر البيانات، وإضافة بياناتك الخاصة، وما إلى ذلك
إيابا. قم بتوفير اسم بنية جينوم UCSC ووصفًا اختياريًا لعرضه فيه
تصفح.
للبدء، ابحث عن مصدر البيانات المطلوب بالانتقال إلى http://genome.ucsc.edu/cgi-
bin/hgGateway واستخدام قائمتي "clade" و"genome" للانتقال إلى الأنواع المطلوبة
ورقم البناء. ستجد اسم مصدر البيانات في المربع الأزرق أسفل شريط التنقل
ضوابط. ابحث عن شيء مثل هذا:
D. متصفح الجينوم ميلانوجاستر – تجميع dm3 (التسلسلات)
يظهر اسم مصدر البيانات قبل كلمة "التجميع"، في هذه الحالة "dm3".
الاستعمال
[خيارات] [ ]
OPTIONS
للحصول على قائمة بجميع المصادر المعترف بها من قبل UCSC يظهر اكتب:
Browse_import_ucsc_db --list
خيارات:
--remove-chr قم بإزالة البادئة "chr" من جميع أسماء الكروموسومات
--list قائمة مصادر البيانات
مثال
مثال: $0 hg19 'الجينوم البشري (hg19)'
استخدم gbrowse_import_ucsc_db عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
