هذا هو الأمر gt-chseqids الذي يمكن تشغيله في موفر الاستضافة المجاني OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
gt-chseqids - تغيير معرفات التسلسل عن طريق التعيين الوارد في ملف التعيين.
موجز
gt com.chseqids [الخيار ...] ملف التعيين [GFF3_file]
الوصف
-نوع [نعم | لا]
قم بفرز ميزات GFF3 بعد تغيير معرفات التسلسل (استهلاك الذاكرة
يتناسب مع حجم ملف الإدخال) (الافتراضي: لا)
-v [نعم | لا]
تكون مطولة (الافتراضي: لا)
-o [اسم الملف]
إعادة توجيه الإخراج إلى ملف محدد (الافتراضي: غير محدد)
-gzip [نعم | لا]
كتابة ملف الإخراج المضغوط gzip (الافتراضي: لا)
-bzip2 [نعم | لا]
كتابة ملف إخراج مضغوط bzip2 (الافتراضي: لا)
-فرض [نعم | لا]
فرض الكتابة إلى ملف الإخراج (الافتراضي: لا)
-مساعدة
عرض المساعدة والخروج
-الإصدار
عرض معلومات الإصدار والخروج
تنسيق الملف لملف Mapping_file:
يحدد ملف التعيين المرفق جدول تعيين يسمى "chseqids". إنه يرسم خريطة
إدخالات منطقة التسلسل الواردة في ملف GFF3_file لأسماء أخرى. يمكن تعريفه بأنه
يتبع:
chseqids = {
chr1 = "seq1"،
chr2 = "seq2"
}
عند استخدام هذا المثال، سيتم تغيير جميع معرفات التسلسل "chr1" إلى "seq1" وكلها
معرفات التسلسل "chr2" إلى "seq2".
التبليغ بق
إبلاغ عن الأخطاء إلى[البريد الإلكتروني محمي]>.
استخدم gt-chseqids عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
