الانجليزيةالفرنسيةإسباني

تشغيل الخوادم | Ubuntu > | Fedora > |


OnWorks فافيكون

GWAMA - على الإنترنت في السحابة

قم بتشغيل GWAMA في مزود استضافة OnWorks المجاني عبر Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت

هذا هو الأمر GWAMA الذي يمكن تشغيله في مزود الاستضافة المجانية OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة على الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت

برنامج:

اسم


GWAMA - التحليل التلوي لرابطة الجينوم على نطاق واسع

موجز


جوامه [الخيارات]

وصف


يقوم برنامج GWAMA (التحليل التلوي لرابطة الجينوم على نطاق واسع) بإجراء تحليل تلوي لـ
نتائج دراسات GWA للصفات الثنائية أو الكمية. الأثر الثابت والعشوائي
يتم إجراء التحليلات التلوية لكل من الأشكال الوراثية للنيوكلوتايد التنميط الجيني والمفترض باستخدام التقديرات
من نسبة الأرجحية الأليلية وفاصل الثقة 95٪ للسمات الثنائية وتقديرات
حجم التأثير الأليلي والخطأ المعياري للصفات الكمية. يمكن استخدام GWAMA
لتحليل نتائج جميع النماذج الجينية المختلفة (مضاعفة ، مضافة ،
مهيمن ، متنحي). يشتمل البرنامج على تسهيلات لتعويض الأخطاء لتحديدها
أخطاء محاذاة الجدائل وتقليب الأليل ، وتجري اختبارات عدم تجانس
الآثار بين الدراسات.

OPTIONS


-i, - قائمة الملفات=اسم الملف
حدد ملفات نتائج الدراسات. الافتراضي = gwama.in

-o, --انتاج=فيليروت
حدد جذر الملف لمخرجات التحليل. الافتراضي = gwama (gwama.out، gwama.gc.out)

-r, --عشوائي
استخدم تصحيح التأثير العشوائي. افتراضي = معطل

-Gc, - التحكم الجيني
استخدم التحكم الجينومي لتعديل ملفات نتائج الدراسات. افتراضي = معطل

-gco, - التحكم_ الجينومي
استخدم التحكم الجينومي في ملخص التحليل التلوي (أي نتائج التحليل التلوي هي
المصححة لـ gc). افتراضي = معطل

-Qt, --كمي
حدد إصدار السمة الكمية (أعمدة BETA و SE). الافتراضي = سمة ثنائية

-m, --خريطة=اسم الملف
حدد اسم الملف لخريطة العلامة.

-t, --عتبة=0-1
عتبة قيمة p لإظهار الاتجاه في اتجاهات تأثير الملخص. افتراضي =
1

- لا توازي
لم يتم إعطاء أي معلومات عن الأليل. نتوقع دائما نفس EA.

- موازية
قد تحتوي علامات أليل على أكثر من حرف واحد. لا الشيكات حبلا.

- جنس إجراء تحليل التباين بين الجنسين والمتباين بين الجنسين (الطريقة الموضحة في
ورقة ماجى ، ليندجرين وموريس 2010). يجب تقديم معلومات النوع في ملف قائمة الملفات.
(العمود الثاني بعد أسماء الملفات إما M أو F).

--name_marker
رأس بديل لعلامة اسم العمود.

--الاسم_السلسلة
رأس بديل لعمود حبلا.

--name_n
رأس بديل لحجم العينة عمود.

- اسم_ع
رأس بديل لتأثير عمود الأليل.

--name_nea
رأس بديل لعمود أليل غير مؤثر.

--name_eaf
رأس بديل لتأثير عمود تردد الأليل.

--name_beta
رأس بديل لعمود بيتا.

--name_se
رأس بديل للأمراض المنقولة جنسياً. يخطئ. العمود.

--name_or
رأس بديل للعمود أو.

--name_or_95l
رأس بديل لعمود OR 95L.

--name_or_95u
رأس بديل لعمود OR 95U.

-h, --مساعدة
اطبع هذه التعليمات.

-v, --الإصدار
اطبع رقم إصدار GWAMA. يجب أن تكون هذه الصفحة اليدوية غير كافية. الرجاء استخدام
خيار المساعدة للحصول على تذكير سريع بخيارات gwama أو الرجوع إلى صفحته الرئيسية
مع الوثائق عبر الإنترنت أو الدليل القابل للتنزيل.

استخدم GWAMA عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net


Ad


Ad