last-pair-probs - عبر الإنترنت في السحابة

برنامج:

اسم

last-pair-probs - قراءة محاذاة الحمض النووي المقترن للجينوم، وإجراء التقديرات

موجز

آخر زوج-probs [خيارات] المحاذاة المتداخلة

آخر زوج-probs [خيارات] المحاذاة1 المحاذاة2

الوصف

قراءة محاذاة الحمض النووي المقترن يقرأ إلى الجينوم، و: (1) تقدير توزيع
المسافات بين القراءات المقترنة، (2) تقدير احتمالية كل محاذاة
يمثل المصدر الجينومي للقراءة.

OPTIONS

-h, --مساعدة
إظهار رسالة المساعدة هذه والخروج

-r, --rna
افترض أن القراءات هي من الحمض النووي الريبي (RNA) الذي يحتمل أن يكون مقسمًا

-e, --estdist
فقط قم بتقدير توزيع المسافات

-m M, - خريطة=M
لا تكتب محاذاة مع احتمالية عدم وجود أخطاء> M (الافتراضي: 0.01)

-f BP ، --fraglen=BP
متوسط ​​المسافة بـ bp

-s BP ، --sdev=BP
الانحراف المعياري للمسافة

-d بروب، --منفصل=اختبار
الاحتمال المسبق لرسم الخرائط المنفصلة (الافتراضي: 0.02 إذا -rوإلا 0.01)

-c كروم، --دائري=كروم
يحدد أن الكروموسوم CHROM دائري (الافتراضي: chrM)

-V, --الإصدار
إظهار رقم إصدار البرنامج والخروج

استخدم last-pair-probs عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net