هذا هو الأمر Maskfeate الذي يمكن تشغيله في مزود الاستضافة المجانية OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة على الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
Maskfeat - اكتب تسلسلًا يحتوي على ميزات مقنعة
موجز
ماسكفيت -تسلسل seqall [من نوع سلسلة] [-لخفض تبديل] -المسكشار سلسلة -تسق seqout
ماسكفيت -مساعدة
الوصف
ماسكفيت هو برنامج سطر أوامر من EMBOSS ("البيولوجيا الجزيئية الأوروبية المفتوحة
مجموعة برامج"). إنه جزء من مجموعة (مجموعات) الأوامر "تحرير ، جداول الميزات".
OPTIONS
إدخال قسم
-تسلسل seqall
إضافي قسم
من نوع سلسلة
افتراضيًا ، يتم إخفاء أي ميزة في جدول الميزات بنوع يبدأ بـ "تكرار".
يمكنك تعيين هذا ليكون أي نوع ميزة ترغب في إخفاءه. ارى
http://www.ebi.ac.uk/embl/WebFeat/ للحصول على قائمة بأنواع ميزات EMBL وانظر
الملحق أ من دليل المستخدم Swissprot بتنسيق http://www.expasy.org/sprot/userman.html
للحصول على قائمة بأنواع ميزات Swissprot. يمكن كتابة حرف بدل باستخدام "*". لو
تريد إخفاء أكثر من نوع واحد ، وفصل أسمائهم بمسافات أو فاصلات ، على سبيل المثال:
* تكرار UTR * القيمة الافتراضية: كرر *
-لخفض تبديل
يمكن إخفاء المنطقة عن طريق تحويل أحرف التسلسل إلى أحرف صغيرة ، وبعضها
يمكن للبرامج التي لا تحتوي على نظام EMBOSS ، مثل fasta ، أن تفسر ذلك على أنه منطقة مقنعة. التسلسل
دون تغيير بصرف النظر عن حالة التغيير. قد ترغب في التأكد من أن التسلسل بأكمله
بأحرف كبيرة قبل إخفاء المناطق المحددة بأحرف صغيرة باستخدام
علم "الدعم". القيمة الافتراضية: N
-المسكشار سلسلة
شخصية لاستخدامها عند اخفاء. الافتراضي هو "X" لتسلسل البروتين ، و "N" للنووية
تسلسل. إذا تم تعيين حرف القناع ليكون حرف المسافة أو حرفًا فارغًا ،
ثم يتم إخفاء التسلسل عن طريق تغييره إلى أحرف صغيرة ، تمامًا كما هو الحال مع
علم "-Lowercase". القيمة الافتراضية: @ ($ (acdprotein)؟ X: N)
الناتج قسم
-تسق seqout
استخدم Maskfeate عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net