هذا هو الأمر pacoxph الذي يمكن تشغيله في مزود الاستضافة المجانية OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
pacoxph - إجراء تحليل الارتباط على مستوى الجينوم باستخدام نموذج المخاطر النسبية لكوكس
موجز
باكوكسف [ سطر الأوامر الخيارات ]
الوصف
باكوكسف يدير انحدارًا خطيًا على مجموعات كبيرة من البيانات المحتسبة بطريقة فعالة.
مزيد من الخيارات
مطلوب: أمر خط الخيارات
-p ، - فينو FILE
قراءة بيانات النمط الظاهري من FILE
-أنا، --معلومات FILE
قراءة معلومات SNP من FILE (مثل ملف MLINFO).
-د، --جرعة FILE
اسم ملف توقع SNP (مثل MLDOSE / MLPROB).
اختياري أمر خط الخيارات
م ، --خريطة FILE
اسم ملف الخريطة ، الذي يحتوي على مواضع الزوج الأساسي لكل SNP.
-ن، - nids عدد
عدد الأشخاص المراد تحليلهم.
-c ، - كروم FILE
الكروموسوم (ليتم تمريره إلى الإخراج).
-o ، --خارج FILE
اسم ملف الإخراج (الافتراضي هو الانحدار. out.txt ).
-س، - سكيبد عدد
كم عدد الأعمدة التي يجب تخطيها في ملف التوقع (الجرعة / الاختبار) (الافتراضي هو 2).
-t ، - النغمات عدد
كم عدد السمات التي يتم تحليلها (الافتراضي هو 2).
-g ، --ngpreds عدد
كم عدد أعمدة التوقع لكل علامة (الافتراضي 1 = MLDOSE ، وإلا استخدم 2 لـ MLPROB).
-a، - منفصل FILE
حرف لحقول منفصلة (الافتراضي هو المسافة).
-r ، --نتيجة
استخدم اختبار النتيجة.
-e، --بلا رأس
لا تبلغ عن سطر العنوان في الإخراج.
-l --الكوف
تقرير تقديرات لجميع المتغيرات المشتركة (مخرجات كبيرة!).
-ب، --تفاعل
المتغير المشترك الذي يجب استخدامه للتفاعل مع تحليل SNP (الافتراضي هو لا
التفاعل ، 0).
-ك، --التفاعل_فقط
اعجاب --تفاعل ولكن دون أن يعمل المتغير المشترك بالتفاعل مع SNP (الافتراضي هو
لا يوجد تفاعل ، 0).
--مساعدة تعليمات الطباعة.
استخدم pacoxph عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
