هذا هو الأمر patmatdbe الذي يمكن تشغيله في موفر الاستضافة المجاني OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
patmatdb - يبحث في تسلسلات البروتين باستخدام نموذج تسلسلي
موجز
com.patmatdb -تسلسل seqall -عنصر سلسلة -ملف تقرير
com.patmatdb -مساعدة
الوصف
com.patmatdb هو برنامج سطر أوامر من EMBOSS ("البيولوجيا الجزيئية الأوروبية المفتوحة
مجموعة برامج"). إنه جزء من مجموعة (مجموعات) قيادة "البروتين: الدوافع".
OPTIONS
إدخال قسم
-تسلسل seqall
مطلوب: قسم
-عنصر سلسلة
تعتمد أنماط patmatdb على تنسيق النمط المستخدم في قاعدة بيانات PROSITE.
على سبيل المثال: '[DE](2)HS{P}X(2)PX(2,4)C' تعني اثنين من Asps أو Glus بأي ترتيب متبع
بواسطة His، Ser، أي بقايا غير Pro، ثم اثنين من أي بقايا متبوعة بـ Pro
تليها اثنين إلى أربعة من أي بقايا تليها Cys. البحث هو
مستقلة عن حالة الأحرف، لذا فإن "AAA" يتطابق مع "aaa".
الناتج قسم
-ملف تقرير
استخدم patmatdbe عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
