هذا هو أمر pepwheel الذي يمكن تشغيله في موفر الاستضافة المجاني OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة عبر الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
pepwheel - ارسم مخططًا للعجلة الحلزونية لتسلسل البروتين
موجز
عجلة الحركة -تسلسل تسلسل -عجلة منطقية [-خطوات عدد صحيح] [- المنعطفات عدد صحيح] -رسم بياني رسم بياني
-amphipathic تبديل -مربعات سلسلة -الماس سلسلة -الثمانيات سلسلة
عجلة الحركة -مساعدة
الوصف
عجلة الحركة هو برنامج سطر أوامر من EMBOSS ("البيولوجيا الجزيئية الأوروبية المفتوحة
مجموعة برامج"). وهو جزء من مجموعة (مجموعات) الأوامر "Display,Protein:2D Structure".
OPTIONS
إدخال قسم
-تسلسل تسلسل
الناتج قسم
-عجلة منطقية
القيمة الافتراضية: ص
-خطوات عدد صحيح
عدد المخلفات المرسومة لكل دورة هو هذه القيمة مقسومة على قيمة "المنعطفات".
القيمة الافتراضية: 18
- المنعطفات عدد صحيح
عدد المخلفات المرسومة لكل دورة هو قيمة "الخطوات" مقسومة على هذه القيمة.
القيمة الافتراضية: 5
-رسم بياني رسم بياني
العلامات قسم
-amphipathic تبديل
إذا كان هذا صحيحا ثم يتم وضع علامة على بقايا ACFGILMVWY كمربعات وكل شيء آخر
البقايا غير مميزة. يؤدي هذا إلى تجاوز أي ترميز آخر قد تكون قمت بتحديده
باستخدام المؤهلات "-squares"، و"-diamonds"، و"-octags".
-مربعات سلسلة
افتراضيًا، يتم وضع علامة على البقايا الأليفاتية ILVM بمربعات. القيمة الافتراضية: ILVM
-الماس سلسلة
بشكل افتراضي، يتم تمييز بقايا DENQST بالماس. القيمة الافتراضية: DENQST
-الثمانيات سلسلة
افتراضيًا، يتم تمييز المخلفات الموجبة الشحنة HKR بالمثمنات. تقصير
القيمة: HKR
استخدم pepwheele عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
