هذا هو الأمر primer3_core الذي يمكن تشغيله في مزود الاستضافة المجانية OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة على الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
primer3_core - تصاميم الاشعال ل PCR
موجز
التمهيدي [-format_output] [-strict_tags] [ ملف_المدخلات]
الوصف
يختار primer3_core البادئات لتفاعلات تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) ، مع الأخذ في الاعتبار المعايير قليلة النوكليوتيد
درجة حرارة الانصهار والحجم ومحتوى GC وإمكانيات ثنائي التمهيدي وحجم منتج PCR ،
القيود الموضعية ضمن تسلسل المصدر ، وقيود أخرى متنوعة.
بشكل افتراضي ، يقبل primer3_core المدخلات وينتج مخرجات بتنسيق Boulder-io ، وهو ما قبل XML
تنسيق الإدخال / الإخراج المستند إلى النص لتنسيق تبادل البيانات من برنامج إلى برنامج. ال
تم وصف تنسيق Boulder-io والأوامر التي يفهمها primer3_core في ملف
README يمكن العثور عليه على أنظمة دبيان بتنسيق / usr / share / doc / primer3 /.
OPTIONS
-تنسيق الإخراج
يطبع تقريرًا أكثر تركيزًا على المستخدم لكل تسلسل.
-strict_tags
primer3_core أصداء وتجاهل أي علامات لا يتعرف عليها ، ما لم يكن
-strict_tags يتم تعيين العلم في سطر الأوامر ، وفي هذه الحالة يقوم primer3_core بطباعة ملف
خطأ في علامة الإخراج PRIMER_ERROR ، ويطبع معلومات إضافية عن stdout ؛
يمكن أن يكون هذا الخيار مفيدًا لأنظمة التصحيح التي تتضمن التمهيدي.
ملاحظات
لم يعد العلم القديم -2x_compat مدعومًا.
EXIT الوضع الرموز
· 0 في التشغيل العادي.
· -1 في ظل الظروف التالية: حجج غير قانونية في سطر الأوامر ، غير قادرة على التفريغ
stdout ، غير قادر على فتح (للكتابة وإنشاء) ملف. for أو .rev أو .int (ربما
بسبب مشكلة حماية).
· -2 في حالة نفاد الذاكرة.
· -3 المدخلات الفارغة.
· -4 خطأ في علامة الإدخال "العالمية" (رسالة في PRIMER_ERROR).
REFERENCE
يرجى الاستشهاد بـ Rozen، S.، Skaletsky، H. "Primer3 على WWW للمستخدمين العامين ولأجل
المبرمجين البيولوجيين. "في S. Krawetz و S. Misener ، محرران. طرق المعلوماتية الحيوية و
البروتوكولات في سلسلة "طرق في البيولوجيا الجزيئية". مطبعة هيومانا ، توتوا ، نيوجيرسي ، 2000 ،
صفحات 365-386.
استخدم primer3_core عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
