pynifti_pst - عبر الإنترنت في السحابة

برنامج:

اسم

pynifti_pst - حساب التسلسل الزمني لبيانات الرنين المغناطيسي الوظيفي

موجز

pynifti_pst [الخيارات] <4dimage> <vol_id | اسم الملف> [...]

الوصف

يحسب pynifti_pst المسار الزمني لإشارة التمعج لجميع وحدات التخزين في وحدة تخزين
بمجرد. يمكن تحديد مجموعات التحفيز كأرقام حجم أو مرات (سيتم تحويلها إلى
أرقام الحجم باستخدام وقت التكرار المقدم). يمكن تحديد Onsets مباشرة على ملف
سطر الأوامر ، ولكن يمكن قراءته أيضًا من ملفات (متعددة). من المفترض أن يتم سرد مثل هذا الملف
بداية واحدة لكل سطر (كالقيمة الأولى). يتم تجاهل الأسطر الفارغة. هذا يتيح pynifti_pst
لاستخدام ملفات EV المخصصة FSL على سبيل المثال. إذا تم تحديد عدة ملفات ، فإن مجموعات القراءة تكون
مجتمعة في ناقل بداية واحد. يكتب pynifti_pst صورة سلسلة زمنية 4d كإخراج.
يمكن تحميل هذه الصورة على سبيل المثال في FSLView لإلقاء نظرة على الدورة الزمنية لكل إشارة voxels في ملف
حالة معينة بمجرد النقر عليها.

OPTIONS

--الإصدار
إظهار رقم إصدار البرنامج والخروج

-h, --مساعدة
إظهار رسالة المساعدة هذه والخروج

- الإسراف
طباعة رسائل الحالة

-n NVOLS ، - nvols=نفولس
اضبط طول الدورة الزمنية المحسوبة لإشارة التمرين (بالأحجام).
الافتراضي: 10

-t, - مرات
إذا تم توفيره ، فسيتم التعامل مع قيم القراءة كأوقات بداية وسيتم تحويلها إلى
أرقام الحجم. لكل بداية سيتم تحديد الحجم الأقرب في الوقت المناسب.
يُفترض أن يتم تسجيل الأحجام تمامًا (وكاملًا) بعد tr / 2 ، على سبيل المثال if
'tr' هي ثانيتان يتم تسجيل المجلد الأول في ثانية واحدة بالضبط. الرجاء مراجعة
--تر و --عوض خيارات لمعرفة كيفية ضبط التحويل.

--تر=TR
وقت التكرار للصورة رباعية الأبعاد (الاختلاف الزمني لمجلدين متتاليين).
يمكن استخدام هذا لتجاوز الإعداد في الصورة رباعية الأبعاد. وقت التكرار هو
ضروري لتحويل أوقات البداية إلى أرقام وحدات التخزين. إذا كان خيار "--times" هو
لم يتم تعيين هذه القيمة ليس لها تأثير. يرجى ملاحظة أن التكرار الوقت و
يجب أن تكون المجموعات الموردة في نفس الوحدة. يرجى ملاحظة أنه إذا - مرات معطى
يجب تحديد tr في نفس الوحدة مثل أوقات بداية القراءة.

--عوض=الأوفست
يتم تطبيق الإزاحة الثابتة على أوقات بدء التشغيل عند تحويلها إلى أرقام وحدات التخزين.
بدون تحديد "- أوقات" هذا الخيار ليس له أي تأثير.

-p, --percsigchg
قم بتحويل المسار الزمني المحسوب إلى النسبة المئوية لتغيير الإشارة بالنسبة إلى الأول
(البداية) الحجم. هذا قد لا يكون ذا مغزى عندما --عملية تم تعيينه لشيء ما
مختلفة عن "يعني". يرجى ملاحظة أن شكل السلاسل الزمنية للحسابات
يعتمد بشدة على متوسط ​​الحجم الأول. قد يكون استخدام ملف
الشرط الأساسي الحقيقي كأصل. ومع ذلك ، هذا غير معتمد حتى الآن. تقصير:
خطأ

- برينتفوكسيل=برينتفوكسل
قم بطباعة التسلسل الزمني لتحويط voxel واحد لجميع المجموعات بشكل منفصل. هذه
ستطبع مصفوفة (مرات الظهور × الوقت) ، حيث يكون عدد الأعمدة مطابقًا لها
قيمة - nvols وعدد الصفوف يتوافق مع العدد المحدد
بدايات. (على سبيل المثال "z، y، x")

--عملية=OPERATION
اختر العملية الحسابية التي يتم إجراؤها لحساب سلاسل زمنية التمعج.
بشكل افتراضي ، هذا هو المتوسط ​​في جميع المحفزات ("يعني"). احتمالات أخرى
هي الانحراف المعياري ('std') والخطأ المعياري ('sde').

استخدم pynifti_pst عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net