هذا هو تطبيق Linux المسمى BamBam والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له باسم bambam-1.4.tgz. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في موفر الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق عبر الإنترنت المسمى BamBam مع OnWorks مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
بامبام
Ad
الوصف
يتضمن BamBam العديد من الأدوات لتحليل بيانات تسلسل الحمض النووي للجيل القادم. يتم توفير الأدوات لاستدعاء SNPs وindels، وتحديد عمليات الحذف واسعة النطاق، وجدولة أعداد القراءات المعينة، وتحليل المثيلة، والمزيد.
يعتمد على SAMtools (http://samtools.sourceforge.net/) وأدوات BAM (https://github.com/pezmaster31/bamtools). يستخدم أيضًا BioPerl، المضمن في ملف القطران الذي تم تنزيله.
المميزات
- استدعاء SNPs وindels
- تنسب الأنماط الجينية
- بناء تسلسل الإجماع
- جدولة أعداد القراءات المعينة (RNA-seq)
- استنتج مراحل النمط الفرداني باستخدام طريقة التجميع K
- تحليل مثيلة الحمض النووي (تسلسل ثنائي الكبريتيت)
الجمهور
بحث علمي
لغة البرمجة
بيرل ، سي ++
الفئات
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/bambam/. وقد تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمة التشغيل المجانية لدينا.