هذا هو تطبيق Linux المسمى BLAST Ring Image Generator والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له كـ BRIG-0.95-dist.zip. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في مزود الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق المسمى BLAST Ring Image Generator مع OnWorks مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
SCREENSHOTS
Ad
بلاست مولد صورة الدائري
الوصف
BRIG هو تطبيق متعدد المنصات (Windows / Mac / Unix) يمكنه عرض مقارنات دائرية بين عدد كبير من الجينومات ، مع التركيز على معالجة بيانات تجميع الجينوم.يرجى الاستشهاد بورقة BRIG إذا تم استخدام BRIG لتوليد أرقام للمنشورات: NF Alikhan، NK Petty، NL Ben Zakour، SA Beatson (2011) BLAST Ring Image Generator (BRIG): مقارنات بسيطة لجينوم بدائيات النوى ، BMC Genomics ، 12: 402. بميد: 21824423
شرح المميزات:
- تظهر الصور تشابهًا بين تسلسل مرجعي مركزي ومتواليات أخرى مثل حلقات متحدة المركز.
- ستقوم BRIG بإجراء جميع مقارنات BLAST وتحليل الملفات تلقائيًا عبر واجهة مستخدم رسومية بسيطة.
- يمكن عرض حدود Contig وقراءة التغطية لمسودة الجينوم ؛ يمكن عرض الرسوم البيانية والتعليقات التوضيحية المخصصة.
- باستخدام مجموعة محددة من الجينات كمدخلات ، يمكن لـ BRIG عرض وجود الجين أو غيابه أو اقتطاعه أو تباينه في التسلسل في مجموعة من الجينومات الكاملة أو مسودة الجينومات أو حتى بيانات التسلسل الأولية غير المجمعة.
- يقبل BRIG أيضًا ملفات رسم الخرائط بتنسيق SAM التي تتيح مقارنة المناطق الجينومية الموجودة في بيانات التسلسل غير المجمعة من عينات متعددة في وقت واحد
الجمهور
بحث علمي
لغة البرمجة
جافا
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/brig/. تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمتنا التشغيلية المجانية.
