هذا هو تطبيق Linux المسمى MCPerm: تبديل Monte Carlo SNP الذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له كـ MCPerm_1.1.2.tar.gz. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في مزود الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق المسمى MCPerm: Monte Carlo SNP باستخدام OnWorks مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
MCPerm: تبديل مونت كارلو SNP
Ad
الوصف
MCPerm: طريقة تبديل مونت كارلو للارتباط متعدد الاختبارات في دراسة ارتباط الحالة والشواهد
يعد اختبار التقليب التقليدي (TradPerm) طريقة تحليل غير بارامترية مهمة يمكن التعامل معها على أنها المعيار الذهبي لتصحيحات الاختبار المتعددة في دراسة ارتباط الحالات والشواهد. ومع ذلك ، فهي تعتمد على الأنماط الجينية وتعدد الأشكال الأصلي للنيوكليوتيدات المفردة (SNP) وبيانات الأنماط الظاهرية لإجراء عدد كبير من المراوغات العشوائية ، وبالتالي فهي مكثفة من الناحية الحسابية ، خاصة بالنسبة لدراسة الارتباط على مستوى الجينوم (GWAS). لتحسين سرعة الحساب دون تغيير حجم قيمة TradPerm p ، قمنا بتطوير طريقة مونت كارلو للتبديل (MCPerm) كبديل فعال لـ TradPerm.
الطرق: لا تحتاج MCPerm إلى خلط بيانات الطرز الجينية والصفات الظاهرية الأصلية. يستخدم طريقة مونت كارلو ، ويستخدم التوزيع الهندسي المفرط من خطوتين لتوليد العدد العشوائي للأنماط الجينية (AA و Aa و aa) في الحالات والضوابط.
لغة البرمجة
B / R
التصنيفات
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/mcperm/. تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمتنا التشغيلية المجانية.
