هذا هو تطبيق Linux المسمى NeedlemanWunsch والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له كـ needleman_wunsch-0.3.5.tar.gz. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في مزود الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق المسمى NeedlemanWunsch مع OnWorks مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
SCREENSHOTS
Ad
نيدلمان
الوصف
انتقل إلى GITHUB: https://github.com/noporpoise/seq-align
محاذاة التسلسل العالمية المثلى باستخدام خوارزمية Needleman-Wunsch.
يحاذي الحمض النووي ، والحمض النووي الريبي ، وتسلسل البروتين والمزيد!
شاهد المحاذاة المحلية لمشروعنا الشقيق باستخدام Smith-Waterman:
http://sourceforge.net/projects/smithwaterman/
شرح المميزات:
- عقوبات فجوة Affine
- لا يمكن وضع فجوة جزائية للفجوات في بداية ونهاية المحاذاة
- الإخراج الملون
- يقرأ FASTA و FASTQ وملفات التسلسل العادي (بما في ذلك ملفات gzip)
- مصفوفات استبدال الحمض النووي / البروتين المحددة مسبقًا (PAM / BLOSUM ، إلخ)
- يمكن تحميل مصفوفات عقوبة الاستبدال
- رمز C المحمول الذي يمكن استخدامه في مشاريع المعلوماتية الحيوية الأخرى
الجمهور
العلوم / البحث والتعليم
واجهة المستخدم
وحدة التحكم / المحطة الطرفية ، سطر الأوامر
لغة البرمجة
سي ++ ، سي
التصنيفات
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/needlemanwunsch/. تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمتنا التشغيلية المجانية.