هذا هو تطبيق Linux المسمى VarScan والذي يمكن تنزيل أحدث إصدار له باسم VarScan.v2.3.9.jar. يمكن تشغيله عبر الإنترنت في مزود الاستضافة المجاني OnWorks لمحطات العمل.
قم بتنزيل وتشغيل هذا التطبيق المسمى VarScan مع OnWorks عبر الإنترنت مجانًا.
اتبع هذه التعليمات لتشغيل هذا التطبيق:
- 1. قم بتنزيل هذا التطبيق على جهاز الكمبيوتر الخاص بك.
- 2. أدخل في مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX باسم المستخدم الذي تريده.
- 3. تحميل هذا التطبيق في هذا الملف.
- 4. ابدأ تشغيل OnWorks Linux عبر الإنترنت أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MACOS عبر الإنترنت من هذا الموقع.
- 5. من نظام تشغيل OnWorks Linux الذي بدأته للتو ، انتقل إلى مدير الملفات الخاص بنا https://www.onworks.net/myfiles.php؟username=XXXXX مع اسم المستخدم الذي تريده.
- 6. قم بتنزيل التطبيق وتثبيته وتشغيله.
SCREENSHOTS
Ad
فارسكان
الوصف
كشف المتغير في التسلسل المتوازي على نطاق واسع. لعينة واحدة ، يتم استدعاء SNPs ، و indels ، والأنماط الجينية المتفق عليها. بالنسبة للأزواج ذات الورم الطبيعي ، يصنف كل متغير على أنه Germline أو Somatic أو LOH ، كما يكتشف تغييرات عدد النسخ الجسدية. يتوفر أحدث إصدار على جيثب
المميزات
- يستدعي SNPs و Indels من ملفات pileup SAMtools
- يقوم بتصفية المتغيرات حسب التغطية وعمق القراءة وتكرار متغير والجودة الأساسية
- يحدد الحالة الجسدية (Somatic ، Germline ، LOH) لأزواج الورم العادي
- يقارن قائمتين من المتغيرات ويدمجهما ويتقاطعان
- يقصر المكالمات المتغيرة على مجموعة من المواضع المستهدفة أو المناطق المستهدفة
- مجانا للاستخدام غير التجاري.
الجمهور
بحث علمي
واجهة المستخدم
سطر الأوامر
لغة البرمجة
جافا
الفئات
هذا تطبيق يمكن جلبه أيضًا من https://sourceforge.net/projects/varscan/. تمت استضافته في OnWorks ليتم تشغيله عبر الإنترنت بأسهل طريقة من أحد أنظمتنا التشغيلية المجانية.