এটি হল আর্ডেন-বিশ্লেষণ কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
আরডেন-বিশ্লেষণ - কৃত্রিম রেফারেন্স জিনোম ম্যাপিংয়ের ফলাফল বিশ্লেষণ করুন
সাইনোপিসিস
arden-বিশ্লেষণ [অপশন] [ইনপুট ফাইল] [আউটপুট ফোল্ডার]...
বর্ণনাঃ
কৃত্রিম রেফারেন্স জিনোম ম্যাপিংয়ের ফলাফল বিশ্লেষণ করার জন্য স্ক্রিপ্ট। এই স্ক্রিপ্ট
একটি নির্দিষ্ট ডেটা সেটে পুটেটিভ TP/FP সনাক্ত করে (পড়া হয়)।
বিকল্প
আউটপুট ফোল্ডার
আউটপুট গন্তব্য ফোল্ডারের পথ।
ইনপুট ফাইল
ini ফাইলে ppath. প্রয়োজনীয় বিন্যাস পেতে উদাহরণ ফাইলগুলি দেখুন।
--সংস্করণ
প্রোগ্রামের সংস্করণ নম্বর দেখান এবং প্রস্থান করুন
-h, --help
এই সাহায্য বার্তাটি দেখান এবং প্রস্থান করুন
-p পিএইচআরইডি, --ফ্রেড=পিএইচআরইডি
ইনপুট রিডের PHRED এনকোডিং উল্লেখ করুন যেমন ইলুমিনা 1.3+ = -p 33 [ডিফল্ট:
33]
-r র্যাঙ্ক, -- অভ্যন্তরীণ পদমর্যাদা=RANK
পড়ার জন্য অভ্যন্তরীণ র্যাঙ্কিং ব্যবহার করুন (পঠিত নামগুলি না হলে প্রয়োজন
লেক্সিকোগ্রাফিকভাবে স্যাম দ্বারা পাইথন এবং আপনার ওএস-এ একইভাবে সাজানো হবে
টুলস) [ডিফল্ট:1]
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে arden-analyze ব্যবহার করুন
