bowtie-build - ক্লাউডে অনলাইন

কার্যক্রম:

NAME এর

bowtie-build - bowtie-এর জন্য একটি কালারস্পেস সূচক তৈরি করা

সাইনোপিসিস

bowtie-বিল্ড [অপশন]*

বর্ণনাঃ

রেফারেন্স_ইন
রেফ সিকোয়েন্স সহ ফাইলগুলির কমা দ্বারা পৃথক করা তালিকা

ebwt_outfile_base
এই dir/basename দিয়ে ফাইলগুলিতে Ebwt ডেটা লিখুন

বিকল্প

-f রেফারেন্স ফাইল ফাস্তা (ডিফল্ট)

-c cmd লাইনে প্রদত্ত রেফারেন্স ক্রম (যেমন )

--বৃহৎ-সূচক
ফোর্স জেনারেটেড ইনডেক্স 'বড়' হতে পারে, এমনকি যদি রেফের 4 বিলিয়নেরও কম থাকে
নিউক্লিয়োটাইডস

-C/---রঙ
একটি কালারস্পেস সূচক তৈরি করুন

-a/---নোয়াটো
স্বয়ংক্রিয় নিষ্ক্রিয় করুন -p/--bmax/--dcv মেমরি-ফিটিং

-p/---প্যাকড
অভ্যন্তরীণভাবে প্যাক করা স্ট্রিং ব্যবহার করুন; ধীর, কম মেম ব্যবহার করে

--বিম্যাক্স
ব্লকওয়াইজ প্রত্যয়-অ্যারে নির্মাতার জন্য max bucket sz

--bmaxdivn
রেফ লেনের বিভাজক হিসাবে সর্বাধিক বালতি এসজেড (ডিফল্ট: 4)

--dcv
ব্লকওয়াইজের জন্য ডিফ-কভার পিরিয়ড (ডিফল্ট: 1024)

--nodc ডিফ-কভার অক্ষম করুন (অ্যালগরিদম চতুর্মুখী হয়ে যায়)

-r/---নোরেফ
.3/.4.ebwt (প্যাকড রেফারেন্স) অংশ তৈরি করবেন না

-3/---justref
শুধু .3/.4.ebwt (প্যাকড রেফারেন্স) অংশ তৈরি করুন

-o/---অফরেট
SA প্রতি 2^offRate BWT অক্ষর নমুনা করা হয় (ডিফল্ট: 5)

-t/---ফতাবচার
প্রারম্ভিক লুকআপে ব্যবহৃত অক্ষরের #টি (ডিফল্ট: 10)

--ntoa হিসাবে রেফারেন্সে Ns রূপান্তর করুন

--বীজ
র্যান্ডম নম্বর জেনারেটরের জন্য বীজ

-q/--- শান্ত
ভার্বোস আউটপুট (ডিবাগিংয়ের জন্য)

-h/--- সাহায্য
টুল এবং এর বিকল্পগুলির বিস্তারিত বিবরণ মুদ্রণ করুন

-- ব্যবহার
এই ব্যবহার বার্তা প্রিন্ট করুন

--সংস্করণ
প্রিন্ট সংস্করণ তথ্য এবং প্রস্থান

64-বিট lgw01-11 বৃহস্পতি নভেম্বর 26:11:11 UTC 03 কম্পাইলার: gcc সংস্করণ 2015 5.2.1-এ নির্মিত
(Ubuntu 5.2.1-25ubuntu1) বিকল্প: -ও3 -ডব্লিউএল, --হ্যাশ-স্টাইল = উভয় -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -ও2
-fstack-রক্ষক-শক্তিশালী -Wformat -ভুল=বিন্যাস-নিরাপত্তা -g -ও2 -fstack-রক্ষক-শক্তিশালী
-Wformat -ভুল=বিন্যাস-নিরাপত্তা -ডব্লিউএল, -সাম্বলিক-ফাংশন -ডব্লিউএল,-z,relro Sizeof {int, long,
দীর্ঘ দীর্ঘ, অকার্যকর*, আকার_টি, অফ_টি}: {4, 8, 8, 8, 8, 8}

onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে bowtie-build ব্যবহার করুন