এটি হল কমান্ড সার্কোস যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
____
/ ___(_)_ __ ___ ___ ___
| | | | '__/ __/ _ \/ __|
| |___| | | | (_| (_) \__ \
\____|__|_| \___\___/|___/
বৃত্তাকার ভাল
circos - বৃত্তাকারভাবে সংমিশ্রিত তথ্য গ্রাফিক্স তৈরি করে
সাইনোপিসিস
# কনফিগারেশন ফাইলের অবস্থান অনুমান করুন
সার্কোস
# নির্দিষ্ট কনফিগারেশন ফাইল ব্যবহার করুন
circos -conf circos.conf [-নীরব]
# প্রয়োজনীয় মডিউল নির্ণয় করুন
সার্কোস-মডিউল
# ম্যান পেজ
circos - man
কোড উপাদানগুলির জন্য # বিস্তারিত ডিবাগিং
# দেখা http://www.circos.ca/documentation/tutorials/configuration/debugging
সার্কোস -ডিবাগ_গ্রুপ GROUP1,[GROUP2,...]
# সম্পূর্ণ ডিবাগিং
circos -debug_group _all
একটি ব্লক (বা ব্লক ট্রি) এর # কনফিগারেশন ডাম্প
# যে কোনো প্যারামিটার যা REGEXP এর সাথে মেলে (ঐচ্ছিক)
circos -cdump [BLOCK1/[BLOCK2/...]]{:REGEXP}
# ওভাররাইডিং কনফিগারেশন প্যারামিটার
সার্কোস -পারম ইমেজ/ব্যাসার্ধ=2000p -পরাম আইডিওগ্রাম/শো=না
# মজার জন্য - ব্যতীত চিত্রের সমস্ত রঙ এলোমেলো করুন
# COLOR1 এবং COLOR2
সার্কোস -এলোমেলো রঙের রঙ 1, [রঙ2,...]
বর্ণনাঃ
সার্কোস হল একটি সার্কুলার লেআউটে ডেটা ভিজ্যুয়ালাইজ করার জন্য, সম্পর্ক অন্বেষণের জন্য আদর্শ৷
বস্তু বা অবস্থানের মধ্যে। একটি বৃত্তাকার বিন্যাস কেন অন্যান্য কারণ আছে
সুবিধাজনক, অন্তত নয় যে এটি আকর্ষণীয়।
সার্কোস একটি সমাধান নয়. এটি ভিজ্যুয়ালাইজেশন সমস্যা সমাধানের একটি টুল। একটি নির্দিষ্ট জন্য
সমস্যা, আপনি নিশ্চিত নন যে এটি উপযুক্ত।
প্রতিটি ডেটা উপাদান কীভাবে প্রদর্শিত হবে তার উপর আপনার সূক্ষ্ম নিয়ন্ত্রণ রয়েছে, আপনাকে মেলাতে সহায়তা করে
প্রাসঙ্গিকতা
কনফিগারেশন
সেটিংস একটি প্লেইন-টেক্সট কনফিগারেশন ফাইল ব্যবহার করে পাস করা বোঝানো হয়। এই ফাইল হতে পারে
ম্যানুয়ালি বা অন্য স্ক্রিপ্ট দ্বারা তৈরি, যা সার্কোসকে সম্পূর্ণ স্বয়ংক্রিয় হতে দেয়।
সম্পূর্ণ ডকুমেন্টেশনের জন্য, দেখুন
L<http://www.circos.ca/documentation/tutorials>
বাক্য গঠন
কনফিগারেশন হল প্লেইন-টেক্সট এবং শ্রেণীবদ্ধ ব্লকের সমন্বয়ে গঠিত। কিছু ব্লক, যেমন
" বাধ্যতামূলক, যখন অন্যরা যেমন " ঐচ্ছিক৷
শুরু করতে, দ্রুত গাইড টিউটোরিয়াল পড়ুন।
L<http://www.circos.ca/documentation/tutorials/quick_guide>
একটি সাধারণ কনফিগারেশন ফাইল এই মত দেখতে পারে
# ছবির আকার এবং বিন্যাস
...
# অবস্থান এবং আইডিওগ্রামের আকার
...
ডেটা ট্র্যাকের # অবস্থান, প্রকার এবং বিন্যাস
...
...
# রং, ফন্ট এবং ফিল প্যাটার্ন
>
# সিস্টেম প্যারামিটার
>
modularity
"> নির্দেশিকা একটি কনফিগারেশন ফাইল অন্যটিতে আমদানি করে। এই
সুবিধা কনফিগারেশন ফাইল মডুলার রাখতে সাহায্য করে।
প্যারামিটার সংজ্ঞা যা ঘন ঘন পরিবর্তন হয় না, যেমন রঙ এবং ফন্ট সংজ্ঞা,
প্রচলিতভাবে পাওয়া ফাইল থেকে আমদানি করা হয় ইত্যাদি/ বিতরণে
টিউটোরিয়ালগুলিতে, আপনি দেখতে পাবেন যে " এবং " ব্লকগুলি আমদানি করা হয়েছে
প্রধান কনফিগারেশন ফাইল। কারণ এই ব্লকগুলি বেশ বড়, প্রধান পেতে পারে
কনফিগারেশন ফাইলটি আরও সুস্পষ্ট হয় যদি সেগুলি পৃথক ফাইলে প্রত্যাবর্তিত হয়।
ওভাররাইডিং সঙ্গে *
একটি ফাইল থেকে অন্তর্ভুক্ত করা একটি প্যারামিটার ওভাররাইড করতে, "*" প্রত্যয় ব্যবহার করুন। প্রত্যয়
প্রয়োজন কারণ একটি প্যারামিটারের একাধিক সংজ্ঞা অনুমোদিত নয়, ক্ষেত্রে ছাড়া
যেখানে একটি প্যারামিটারের একাধিক মান থাকতে পারে।
# অন্তর্ভুক্ত ফাইল 'ব্যাসার্ধ' সংজ্ঞায়িত করে
>
# এটি ব্যাসার্ধের মানকে ওভাররাইড করবে
ব্যাসার্ধ* = 2500p
কোন ব্লকে কোন মান প্রাধান্য পাবে তা নির্দিষ্ট করতে "*" প্রত্যয়টি পুনরাবৃত্তি করা যেতে পারে।
ব্যাসার্ধ = 1500p
ব্যাসার্ধ* = 2500p
ব্যাসার্ধ** = 3000p # ব্যাসার্ধের এই উদাহরণটি ব্যবহার করা হবে
ওভাররাইডিং সঙ্গে আদেশ লাইন
একটি অনন্য ব্লক নামের যেকোনো কনফিগারেশন প্যারামিটার কমান্ড লাইনে নির্দিষ্ট করা যেতে পারে
ব্যবহার
-পরম PATH/PARAM=মান
উদাহরণ স্বরূপ,
প্রদর্শন = না
...
-পরম আইডিওগ্রাম/শো=না
এবং
ডিফল্ট = 0.01r
...
-পরাম আইডিওগ্রাম/স্পেসিং/ডিফল্ট=0.01r
কখন conf() একটি প্যারামিটারের মান পুনরুদ্ধার করতে কনফিগারেশন ফাইলে ব্যবহার করা হয় (যেকোন
প্যারামিটার, শুধুমাত্র -পরম দ্বারা সেট করা নয়), আপনি পরিবর্তন করার জন্য একটি নমনীয় সিস্টেম পাবেন
কমান্ড লাইনে কনফিগারেশন।
প্রজাতি = মানুষ
karytotype = data/karyotype/karyotype.conf(species).txt
-পরম প্রজাতি = ইঁদুর
একাধিক পরামিতি পুনরায় সংজ্ঞায়িত করা যেতে পারে, প্রত্যেকটির নিজস্ব "-পরম" পতাকা সহ
-পরম শো_টিক্স=নো -পরাম চিত্র/ব্যাসার্ধ=2000p
মার্জ হচ্ছে ব্লক
নিম্নলিখিত ব্লকগুলির একাধিক উদাহরণ স্বয়ংক্রিয়ভাবে একত্রিত হয়: ",
", ", ", ", ", " এবং "৷
এর উদ্দেশ্য হল আপনাকে ক্যানোনিকাল সংজ্ঞা যোগ করার অনুমতি দেওয়া।
# এই ফাইলটি ডিফল্ট , এবং সংজ্ঞায়িত করে
>
# রং ব্লক যোগ করুন
mycolor = 150,25,25
বিকল্প
কনফিগারেশন
- ফাইল কনফিগার করুন
কনফিগারেশন ফাইলের নাম। এই প্রয়োজন.
সার্কোস এই ফাইলের অবস্থান অনুমান করার চেষ্টা করবে, "circos.conf" এর জন্য অনুসন্ধান করবে
".", "..", এবং "../ ..".
আউটপুট বিন্যাস
-png, -nopng
-svg, -nosvg
PNG এবং SVG ফাইলের আউটপুট টগল করে।
ভাবমূর্তি উপাদানসমূহ
-শো_টিক্স, -নোশো_টিক্স
-শো_টিক_লেবেল, -নোশো_টিক_লেবেল
টিক এবং তাদের লেবেলগুলির প্রদর্শন ওভাররাইড করুন৷ এই উভয় সাধারণত সংজ্ঞায়িত করা হয়
ব্লক।
আউটপুট পথ
-আউটপুটডির ডিআইআর, -ডির ডিআইআর
-আউটপুট ফাইল ফাইল, -ফাইল ফাইল
আউটপুট ডিরেক্টরি এবং ফাইলের নাম পরিবর্তন করুন। FILE-এ একটি পাথ থাকতে পারে।
ডিবাগ করা
-ডিবাগ
মৌলিক ডিবাগিং আউটপুট চালু করুন। থেকে তথ্য রিপোর্ট
চিত্র, io, স্তর, সারাংশ, টাইমার
ডিবাগ গ্রুপ (নীচে দেখুন)।
-debug_group {+-}GROUP1,[{+-}GROUP2,...]
নির্দিষ্ট গ্রুপের জন্য ডিবাগিং আউটপুট চালু করুন। গ্রুপের তালিকার জন্য, দেখুন
L<http://www.circos.ca/documentation/tutorials/configuration/debugging>
আউটপুটে একটি গ্রুপ যোগ করার জন্য এটি + দিয়ে উপসর্গ করুন। এটি অপসারণ করতে, সঙ্গে -.
# ডিফল্ট ডিবাগিং গ্রুপ ব্যবহার করুন কিন্তু স্তর এবং io বাদ দিন
-ডিবাগ -ডিবাগ_গ্রুপ -লেয়ার,-io
# ডিফল্ট ডিবাগিং গ্রুপ ব্যবহার করুন এবং ফাঁক যোগ করুন
-ডিবাগ -ডিবাগ_গ্রুপ +স্পেসিং
# সুস্পষ্টভাবে গ্রুপগুলি নির্দিষ্ট করুন
-ডিবাগ_গ্রুপ png,io,টাইমার
সমর্থিত গোষ্ঠীগুলির তালিকা করতে, যুক্তি ছাড়াই পতাকা ব্যবহার করুন
-ডিবাগ_গ্রুপ
-time
সময়ের তথ্য রিপোর্ট করুন। -ডিবাগ_গ্রুপ +টাইমারের মতো
- নীরব
কোন রিপোর্টিং তৈরি করুন.
-প্যারানয়েড, -নোপ্যারনয়েড
প্যারানয়েড মোডে চালান (ডিফল্ট), বা না। এই সেটিং এর জন্য ডিফল্ট দ্বারা সংজ্ঞায়িত করা হয়
etc/housekeeping.conf-এ 'প্যারানয়েড'।
-সতর্কতা, -আবার সতর্কতা
সতর্কতা প্রদর্শন করুন, বা না (ডিফল্ট)। এই সেটিং এর জন্য ডিফল্ট দ্বারা সংজ্ঞায়িত করা হয়
etc/housekeeping.conf-এ 'সতর্কতা'।
-জাল ত্রুটি = আইটেম -জাল ত্রুটি CAT = আইটেম -জাল ত্রুটি ,আইডি = আইটেম -জাল ত্রুটি CAT,আইডি
ক্যাটাগরি ক্যাট এবং এরর নাম আইডির জন্য ত্রুটি বার্তা প্রদর্শন করে একটি ত্রুটি জাল করুন। যদি
একটি বা কোনটি নির্দিষ্ট করা নেই, কোন ত্রুটিগুলি পাওয়া যায় তার তালিকা।
আপনি যদি সত্যিকারের ত্রুটি বার্তাগুলি দেখতে উপভোগ না করেন, তবে আপনার কাছে সামান্য কারণ থাকা উচিত
এই ব্যবহার করতে চান.
ব্যবহার
-version
সংস্করণ দেখান।
-হেল্প
সংক্ষিপ্ত ব্যবহারের সংক্ষিপ্ত বিবরণ দেখান।
-মানুষ
ম্যান পেজ দেখান।
গুফিং কাছাকাছি
-এলোমেলো রঙ [রঙ1,রঙ2,...]
একটি ঐচ্ছিক তালিকা ব্যতীত চিত্রের প্রতিটি উপাদানের রঙ র্যান্ডমাইজ করুন
রং।
উদাহরণস্বরূপ, ব্যাকগ্রাউন্ড সাদা এবং কালো যা কিছু রাখতে,
- এলোমেলো রঙ সাদা, কালো
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে সার্কোস ব্যবহার করুন
