কভারেজকাউন্ট - ক্লাউডে অনলাইন

কার্যক্রম:

NAME এর

coverageCount - সমগ্র প্রতিটি অবস্থানে ম্যাপ করা পাঠের কভারেজ গণনা করা
রেফারেন্স জিনোম

বর্ণনাঃ

কভারেজকাউন্ট সংস্করণ 1.5.0-p1

এই প্রোগ্রামটি প্রতিটি অবস্থানে ম্যাপ করা পাঠের কভারেজ গণনা করে

রেফারেন্স জিনোম। এটি সংযুক্ত করে প্রতিটি ক্রোমোজোমের জন্য একটি বাইনারি ফাইল তৈরি করে
4-বাইট পূর্ণসংখ্যা হিসাবে কভারেজ স্তর।

ব্যবহার

কভারেজ কাউন্ট [বিকল্প] -i -o

প্রয়োজনীয় যুক্তি:

-i
SAM বা BAM ফরম্যাটে ইনপুট ফাইলের নাম।

-o
আউটপুট ফাইলের উপসর্গ। প্রতিটি আউটপুট ফাইলে চার বাইট পূর্ণসংখ্যা থাকে

ঐচ্ছিক যুক্তি:

--maxMOp একটি CIGAR স্ট্রিং-এ সর্বাধিক সংখ্যক 'M' অপারেশন অনুমোদিত৷

ডিফল্টরূপে 10. 'X' এবং '=' উভয়কেই 'M' হিসাবে গণ্য করা হয় এবং সংলগ্ন 'M' অপারেশনগুলি
CIGAR স্ট্রিং-এ একত্রিত হয়েছে।

কভারেজকাউন্ট সংস্করণ 1.5.0-p1

এই প্রোগ্রামটি প্রতিটি অবস্থানে ম্যাপ করা পাঠের কভারেজ গণনা করে

রেফারেন্স জিনোম। এটি সংযুক্ত করে প্রতিটি ক্রোমোজোমের জন্য একটি বাইনারি ফাইল তৈরি করে
4-বাইট পূর্ণসংখ্যা হিসাবে কভারেজ স্তর।

ব্যবহার

কভারেজ কাউন্ট [বিকল্প] -i -o

প্রয়োজনীয় যুক্তি:

-i
SAM বা BAM ফরম্যাটে ইনপুট ফাইলের নাম।

-o
আউটপুট ফাইলের উপসর্গ। প্রতিটি আউটপুট ফাইলে চার বাইট পূর্ণসংখ্যা থাকে

ঐচ্ছিক যুক্তি:

--maxMOp একটি CIGAR স্ট্রিং-এ সর্বাধিক সংখ্যক 'M' অপারেশন অনুমোদিত৷

ডিফল্টরূপে 10. 'X' এবং '=' উভয়কেই 'M' হিসাবে গণ্য করা হয় এবং সংলগ্ন 'M' অপারেশনগুলি
CIGAR স্ট্রিং-এ একত্রিত হয়েছে।

onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে coverageCount ব্যবহার করুন