এটি হল ডিফসেক কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
diffseq - দুটি অনুরূপ অনুক্রমের বৈশিষ্ট্য তুলনা করুন এবং রিপোর্ট করুন
সাইনোপিসিস
diffseq -অনুযায়ী ক্রম -অনুক্রমে ক্রম শব্দ আকার পূর্ণসংখ্যা
[- বৈশ্বিক পার্থক্য বুলিয়ান] -আউটফাইল রিপোর্ট -আউটফিট featout - boutfeat featout
diffseq -হেল্প
বর্ণনাঃ
diffseq এটি EMBOSS এর একটি কমান্ড লাইন প্রোগ্রাম ("ইউরোপীয় আণবিক জীববিজ্ঞান ওপেন
সফটওয়্যার স্যুট"). এটি "সারিবদ্ধকরণ: পার্থক্য" কমান্ড গ্রুপ(গুলি) এর অংশ।
বিকল্প
ইনপুট অধ্যায়
-অনুযায়ী ক্রম
-অনুক্রমে ক্রম
প্রয়োজনীয় অধ্যায়
শব্দ আকার পূর্ণসংখ্যা
দুটি সিকোয়েন্সের মধ্যে অনুরূপ অঞ্চলগুলি একটি হ্যাশ টেবিল তৈরি করে পাওয়া যায়
'শব্দ আকার' পরবর্তী অনুগামী। 10 একটি যুক্তিসঙ্গত ডিফল্ট। এই মানটিকে বড় করা হচ্ছে (20?)
প্রোগ্রামটিকে কিছুটা গতি বাড়াতে পারে, তবে এর অর্থ হবে যে কোনও দুটি পার্থক্য রয়েছে
একে অপরের 'শব্দ আকার' পার্থক্যের একক অঞ্চল হিসাবে গোষ্ঠীবদ্ধ করা হবে। এই মান
কাছাকাছি পার্থক্য রেজোলিউশন উন্নত করতে ছোট করা হতে পারে (4?), কিন্তু
প্রোগ্রাম অনেক ধীর হবে. ডিফল্ট মান: 10
অতিরিক্ত অধ্যায়
- বৈশ্বিক পার্থক্য বুলিয়ান
সাধারণত এই প্রোগ্রামটি পরিচিতির অঞ্চলগুলি খুঁজে পাবে যেগুলির দৈর্ঘ্য
নির্দিষ্ট শব্দ-আকার বা বড় এবং তারপরের মধ্যে পার্থক্যের অঞ্চলগুলি রিপোর্ট করবে
এই মিলিত অঞ্চল. এটি ভাল কাজ করে এবং বেশিরভাগ লোকেরা যদি তা চায় তবে তা হয়
দীর্ঘ ওভারল্যাপিং নিউক্লিক অ্যাসিড ক্রম সঙ্গে কাজ. আপনি সাধারণত আগ্রহী নন
এই ক্রমগুলির অ-ওভারল্যাপিং প্রান্তে। যদি আপনার প্রোটিন সিকোয়েন্স বা ছোট থাকে
আরএনএ সিকোয়েন্স তবে, আপনি একেবারে শেষের পার্থক্যে আগ্রহী হবেন। এটা
এই বিকল্পটি সত্য হিসাবে সেট করা হয়েছে তারপর প্রান্তে থাকা পার্থক্যগুলিও রিপোর্ট করা হবে।
ডিফল্ট মান: N
আউটপুট অধ্যায়
-আউটফাইল রিপোর্ট
-আউটফিট featout
প্রথম সিকোয়েন্সের বৈশিষ্ট্যগুলির আউটপুটের জন্য ফাইল ডিফল্ট মান: $(asequence.name).diffgff
- boutfeat featout
দ্বিতীয় সিকোয়েন্সের বৈশিষ্ট্যগুলির আউটপুটের জন্য ফাইল ডিফল্ট মান: $(bsequence.name).diffgff
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে diffseqe ব্যবহার করুন
