এটি হল EDTSurf কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
EDTSurf - ম্যাক্রোমোলিকুলার পৃষ্ঠতলের দ্রুত এবং সঠিক নির্মাণ
সাইনোপিসিস
EDTSurf -i pdbname...
বর্ণনাঃ
EDTSurf ম্যাক্রোমোলিকিউলের জন্য ত্রিভুজাকার পৃষ্ঠতল নির্মাণের জন্য একটি ওপেন সোর্স প্রোগ্রাম। এটা
তিনটি প্রধান ম্যাক্রোমলিকুলার পৃষ্ঠ তৈরি করে: ভ্যান ডের ওয়ালস পৃষ্ঠ, দ্রাবক-অ্যাক্সেসযোগ্য
পৃষ্ঠ এবং আণবিক পৃষ্ঠ (দ্রাবক-বর্জিত পৃষ্ঠ)। EDTsurf এছাড়াও cavities সনাক্ত করে
যা ম্যাক্রোমলিকিউলের ভিতরে থাকে।
বিকল্প
-o আউটনাম
-t 1-MC 2-VCMC
-s 1-VWS 2-SAS 3-MS 4-SES
-c 1-বিশুদ্ধ 2-পরমাণু 3-শৃঙ্খল
-p প্রোবের ব্যাসার্ধ [0,2.0]
-f স্কেল ফ্যাক্টর (0,20.0]
-h 1-ইন এবং আউট 2-আউট 3-ইঞ্চি
output1: outname.ply
output2: outname.asa
output3: outname-cav.pdb
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে EDTSurf ব্যবহার করুন
