এটি epestfinde কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
epestfind - সম্ভাব্য প্রোটিওলাইটিক ক্লিভেজ সাইট হিসাবে PEST মোটিফ খুঁজে পায়
সাইনোপিসিস
epestfind -ক্রম ক্রম [- mwdata তথ্য ফাইল] -জানলা পূর্ণসংখ্যা - আদেশ নির্বাচন
[- প্রান্তিক ভাসা] -মনো বুলিয়ান -সম্ভাব্য বুলিয়ান -পুর বুলিয়ান
-অবৈধ বুলিয়ান -ম্যাপ বুলিয়ান -আউটফাইল আউটফাইল -চিত্রলেখ xygraph
epestfind -হেল্প
বর্ণনাঃ
epestfind এটি EMBOSS এর একটি কমান্ড লাইন প্রোগ্রাম ("ইউরোপীয় আণবিক জীববিজ্ঞান ওপেন
সফটওয়্যার স্যুট"). এটি "প্রোটিন: মোটিফস" কমান্ড গ্রুপ(গুলি) এর অংশ।
বিকল্প
ইনপুট অধ্যায়
-ক্রম ক্রম
প্রোটিন ক্রম USA বিশ্লেষণ করা হবে.
- mwdata তথ্য ফাইল
ডিফল্ট মান: Emolwt.dat
প্রয়োজনীয় অধ্যায়
-জানলা পূর্ণসংখ্যা
ইতিবাচক চার্জযুক্ত অ্যামিনো অ্যাসিডের মধ্যে ন্যূনতম দূরত্ব। ডিফল্ট মান: 10
- আদেশ নির্বাচন
আউটপুট ফাইলের নাম যা বিশ্লেষণের ফলাফল ধারণ করে। ফলাফল বাছাই করা যেতে পারে
দৈর্ঘ্য, অবস্থান এবং স্কোর দ্বারা। ডিফল্ট মান: স্কোর
অতিরিক্ত অধ্যায়
- প্রান্তিক ভাসা
সম্ভাব্য PEST মোটিফ থেকে দুর্বল বৈষম্যের জন্য থ্রেশহোল্ড মান। বৈধ PEST মোটিফ হয়
এই থ্রেশহোল্ড স্কোরের উপর নির্ভর করে 'দরিদ্র' এবং 'সম্ভাব্য' মোটিফগুলিতে বৈষম্য করা হয়েছে। দ্বারা
ডিফল্ট, পরীক্ষামূলক ডেটার উপর ভিত্তি করে ডিফল্ট মান +5.0 সেট করা হয়। পরিবর্তন হয়
সুপারিশ করা হয় না কারণ তাত্পর্য জীববিজ্ঞানের বিষয়, গণিত নয়। ডিফল্ট
মান: +5.0
অগ্রসর অধ্যায়
-মনো বুলিয়ান
ডিফল্ট মান: N
-সম্ভাব্য বুলিয়ান
সম্ভাব্য PEST মোটিফগুলি প্রিন্ট করা উচিত কিনা তা নির্ধারণ করুন। ডিফল্ট মান: Y
-পুর বুলিয়ান
দরিদ্র PEST মোটিফগুলি মুদ্রিত করা উচিত কিনা তা নির্ধারণ করুন। ডিফল্ট মান: Y
-অবৈধ বুলিয়ান
অবৈধ PEST মোটিফগুলি প্রিন্ট করা উচিত কিনা তা স্থির করুন৷ ডিফল্ট মান: N
-ম্যাপ বুলিয়ান
PEST মোটিফগুলিকে ক্রম অনুসারে ম্যাপ করা উচিত কিনা তা স্থির করুন৷ ডিফল্ট মান: Y
আউটপুট অধ্যায়
-আউটফাইল আউটফাইল
ফাইলের নাম যেখানে ফলাফল লেখা হবে।
-চিত্রলেখ xygraph
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে epestfinde ব্যবহার করুন
