এটি হল FCluster কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
AmpliconNoise - উচ্চ থ্রুপুট নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্স ডেটা থেকে শব্দ অপসারণ করুন
সংস্করণ
এই ডকুমেন্টেশন সংস্করণ 1.22 উল্লেখ করে
সাইনোপিসিস
দেখ /usr/share/doc/ampliconnoise/Doc.pdf.gz কিভাবে চালাতে হয় তার বিস্তারিত জানার জন্য।
বর্ণনাঃ
নিম্নলিখিত সরঞ্জাম অন্তর্ভুক্ত করা হয়. উদাহরণস্বরূপ, তাদের বেশিরভাগেরই একটি MPI সমতুল্য রয়েছে
SeqNoise এর একটি সমতুল্য SeqNoiseM আছে যা mpirun এর সাথে ব্যবহার করা যেতে পারে।
ফাস্ট ইউনিক - ফাস্টা ফাইলের প্রতিলিপি করে
-ইন স্ট্রিং ইনপুট ফাইলের নাম
বিকল্প:
FCluster
- স্ট্রিং দূরত্ব ইনপুট ফাইলের নাম
-আউট স্ট্রিং আউটপুট ফাইল স্টাব
বিকল্প:
-আর রেজোলিউশন
- একটি গড় সংযোগ
-w ওজন ব্যবহার করুন
-আমি শনাক্তকারী পড়ি
-s স্কেল dist.
NDist - একটি ফাস্টা ফাইল থেকে পেয়ারওয়াইজ নিডলম্যান-উন্স সিকোয়েন্স ডিসটেন্স ম্যাট্রিক্স
-ইন স্ট্রিং ফাটা ফাইলের নাম
বিকল্প:
-i আউটপুট শনাক্তকারী
পারসিয়াস - দানবকে হত্যা করে
-sin স্ট্রিং seq ফাইলের নাম
বিকল্প:
-টিন স্ট্রিং রেফারেন্স সিকোয়েন্স ফাইল
- একটি আউটপুট প্রান্তিককরণ
-d ভারসাম্যহীনতা ব্যবহার করুন
-rin স্ট্রিং লুকআপ ফাইলের নাম
পাইরোডিস্ট - ফ্লোগ্রাম থেকে যুগলভাবে দূরত্ব ম্যাট্রিক্স
-ইন স্ট্রিং ফ্লো ফাইলের নাম
-আউট স্টাব আউট ফাইল স্টাব
বিকল্প:
-ni dat ফাইলে কোন সূচক নেই
-rin স্ট্রিং লুকআপ ফাইলের নাম
PyroNoise - সারিবদ্ধকরণ ছাড়া ক্লাস্টার ফ্লোগ্রাম
-din স্ট্রিং ফ্লো ফাইলের নাম
-আউট স্ট্রিং ক্লাস্টার ইনপুট ফাইলের নাম
-লিন স্ট্রিং তালিকা ফাইল
বিকল্প:
-v verbose
-c দ্বিগুণ প্রাথমিক কাট-অফ
-ni dat ফাইলে কোন সূচক নেই
- এর দ্বিগুণ নির্ভুলতা
-রিন ফাইল লুকআপ ফাইলের নাম
SeqDist - একটি ফাস্টা ফাইল থেকে জোড়ার মত দূরত্ব ম্যাট্রিক্স
-ইন স্ট্রিং ফাস্টা ফাইলের নাম
বিকল্প:
-i আউটপুট শনাক্তকারী
-rin স্ট্রিং লুকআপ ফাইলের নাম
SeqNoise - ক্লাস্টার সিকোয়েন্স
-ইন স্ট্রিং সিকোয়েন্স ফাইলের নাম
-din স্ট্রিং দূরত্ব ম্যাট্রিক্স ফাইলের নাম
-আউট স্ট্রিং ক্লাস্টার ইনপুট ফাইলের নাম
-লিন স্ট্রিং তালিকা ফাইল
বিকল্প:
-মিন ম্যাপিং ফাইল
-v verbose
-c দ্বিগুণ প্রাথমিক কাট-অফ
- এর দ্বিগুণ নির্ভুলতা
-rin স্ট্রিং লুকআপ ফাইলের নাম
স্প্লিটক্লাস্টার ইভেন
-din স্ট্রিং dat ফাইলের নাম
-মিন স্ট্রিং মানচিত্র ফাইলের নাম
-টিন স্ট্রিং ট্রি ফাইলের নাম
-s বিভক্ত আকার
-মি মিনিট সাইজ
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে FCluster ব্যবহার করুন
