ফক্স - ক্লাউডে অনলাইন

কার্যক্রম:

NAME এর

fox - বিবর্তন ডেটা থেকে ab-initio গঠন নির্ধারণ

সাইনোপিসিস

শিয়াল [অপশন] [file.xml]

বর্ণনাঃ

সার্জারির শিয়াল (ফ্রি অবজেক্ট ফর ক্রিস্টালোগ্রাফি) প্রোগ্রামটি অ্যাব ইনটিও ক্রিস্টালের জন্য তৈরি করা হয়েছিল
বিবর্তন তথ্য থেকে গঠন সমাধান. ab initio এর জন্য এর সবচেয়ে আকর্ষণীয় বৈশিষ্ট্য
গঠন নির্ধারণ হল:

* স্ফটিক বিষয়বস্তু বহুমুখী বর্ণনা;

* পলিহেড্রার মধ্যে বিশেষ অবস্থান এবং ভাগ করা পরমাণুর জন্য স্বয়ংক্রিয় সংশোধন;

* একযোগে একাধিক পাউডার প্যাটার্ন ব্যবহার করার ক্ষমতা;

* স্মার্ট গ্লোবাল অপ্টিমাইজেশান অ্যালগরিদম;

* একটি 3D ক্রিস্টাল স্ট্রাকচার ভিউ এবং লাইভ আপডেট সহ একটি গ্রাফিকাল ইন্টারফেস
অপ্টিমাইজেশান প্রক্রিয়া।

বিকল্প

এই প্রোগ্রামটি কমান্ড লাইন বিকল্প বা ইনপুট ফাইল (file.xml) সহ বা ছাড়াই চালানো হবে।
এটি সাধারণ GNU কমান্ড লাইন সিনট্যাক্স অনুসরণ করে, দুটি ড্যাশ দিয়ে শুরু হওয়া দীর্ঘ বিকল্পগুলির সাথে
(`-')। বিকল্পগুলির একটি সারাংশ নীচে অন্তর্ভুক্ত করা হয়েছে। একটি সম্পূর্ণ বিবরণের জন্য, শিয়াল দেখুন
উইকি http://objcryst.sourceforge.net/Fox/Manual

--help বিকল্পগুলির সারাংশ দেখান।

--loadfouriergrd map.grd
(প্রথম) স্ফটিক কাঠামো সহ 'map.grd' ফোরিয়ার মানচিত্র লোড এবং প্রদর্শন করুন

--loadfourierdsn6 মানচিত্র।DN6
(প্রথম) স্ফটিক কাঠামো সহ একটি DSN6 ফোরিয়ার মানচিত্র লোড করুন এবং প্রদর্শন করুন

--নোগুই
GUI ছাড়া চালান, স্বয়ংক্রিয়ভাবে অপ্টিমাইজেশান চালু করে --nogui এর সাথে হতে পারে
নিম্নলিখিত বিকল্পগুলি:

-n 10000
সর্বাধিক 10000 ট্রায়ালের জন্য চালান (ডিফল্ট: 1000000)

--এনব্রুন 5
5 রান করুন, প্রতিটি রানের আগে এলোমেলো করে (ডিফল্ট: 1), অনির্দিষ্টভাবে চালানোর জন্য -1 ব্যবহার করুন

-o out.xml
'out.xml'-এ আউটপুট

--এলোমেলো করা
প্রাথমিক কনফিগারেশন র্যান্ডমাইজ করুন

--চুপ
(প্রায়) কোন টেক্সট আউটপুট উত্পাদন

--চূড়ান্ত খরচ 0.15
খরচ <0.15 পর্যন্ত অপ্টিমাইজেশান চালান

--cif2 প্যাটার্ন 1.5406 170 5000 .1
ইনপুট ক্রিস্টালের জন্য প্যাটার্ন অনুকরণ করুন, তরঙ্গদৈর্ঘ্য = 1.5406 170 পয়েন্ট সহ 500° পর্যন্ত
0.1° এর চূড়া প্রস্থ

উদাহরণ

শিয়াল silicon.xml
'silicon.xml' ফাইল লোড করুন এবং GUI চালু করুন।

শিয়াল Cimetidine-powder.xml --নোগুই --এলোমেলো করা -n 1000000 -o best.xml
'ktartrate.xml' ফাইল লোড করুন, র্যান্ডমাইজ করুন, তারপর 1 মিলিয়ন ট্রায়ালের 1টি অপ্টিমাইজেশান করুন,
এবং 'best.xml'-এ সেরা কাঠামো সংরক্ষণ করুন।

শিয়াল Cimetidine-powder.xml --নোগুই --এলোমেলো করা -n 10000000 --এনব্রুন 10 -o best.xml
'Cimetidine-powder.xml' ফাইল লোড করুন, তারপর 10 রান করুন (একটি এলোমেলো থেকে শুরু করুন)
কাঠামো) 10 মিলিয়ন ট্রায়ালের (প্রতিটি রান একটি xml ফাইল সংরক্ষণ করে), এবং সেরা সংরক্ষণ করুন
'best.xml'-এ গঠন।

শিয়াল Cimetidine-powder.xml --নোগুই --চুপ --এলোমেলো করা -n 10000000 --এনব্রুন 10 --চূড়ান্ত খরচ
200000 -o best.xml
'Cimetidine-powder.xml' ফাইল লোড করুন, তারপর 10 মিলিয়ন ট্রায়ালের 10 নীরব রান করুন
(প্রতিটি রান একটি xml ফাইল সংরক্ষণ করে), এবং 'best.xml'-এ সেরা কাঠামো সংরক্ষণ করুন। প্রতিটির জন্য, প্রত্যেকটির জন্য
চালান, খরচ 200000 এর নিচে গেলে অপ্টিমাইজেশন বন্ধ হয়ে যায়।

onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে ফক্স অনলাইন ব্যবহার করুন