fuzztrane - ক্লাউডে অনলাইন

কার্যক্রম:

NAME এর

fuzztran - প্রোটিন সিকোয়েন্সে প্যাটার্ন অনুসন্ধান করুন (অনুবাদিত)

সাইনোপিসিস

fuzztran -ক্রম seqall -প্যাটার্ন প্যাটার্ন [-ফ্রেম তালিকা] [-টেবিল তালিকা] -আউটফাইল রিপোর্ট

fuzztran -হেল্প

বর্ণনাঃ

fuzztran এটি EMBOSS এর একটি কমান্ড লাইন প্রোগ্রাম ("ইউরোপীয় আণবিক জীববিজ্ঞান ওপেন
সফটওয়্যার স্যুট"). এটি "নিউক্লিক:মোটিফস,প্রোটিন:মোটিফস" কমান্ড গ্রুপ(গুলি) এর অংশ।

বিকল্প

ইনপুট অধ্যায়
-ক্রম seqall

-প্যাটার্ন প্যাটার্ন
অ্যামিনো অ্যাসিডগুলির জন্য আদর্শ IUPAC এক-অক্ষরের কোডগুলি ব্যবহার করা হয়। প্রতীক 'x'
এমন একটি অবস্থানের জন্য ব্যবহার করা হয় যেখানে যেকোনো অ্যামিনো অ্যাসিড গ্রহণ করা হয়। অস্পষ্টতা দ্বারা নির্দেশিত হয়
বর্গাকার বন্ধনীর মধ্যে একটি প্রদত্ত অবস্থানের জন্য গ্রহণযোগ্য অ্যামিনো অ্যাসিড তালিকা করা
]'। যেমন: [ALT] মানে Ala বা Leu বা Thr। অস্পষ্টতা এছাড়াও দ্বারা নির্দেশিত হয়
এক জোড়া কোঁকড়া বন্ধনীর মধ্যে তালিকাভুক্ত করা হচ্ছে '{ }' অ্যামিনো অ্যাসিড যা গ্রহণযোগ্য নয়
একটি নির্দিষ্ট অবস্থানে যেমন: {AM} মানে Ala এবং Met ব্যতীত যেকোনো অ্যামিনো অ্যাসিড।
একটি প্যাটার্নের প্রতিটি উপাদান একটি '-' দ্বারা তার প্রতিবেশী থেকে পৃথক করা হয়। (এতে ঐচ্ছিক
fuzztran) প্যাটার্নের একটি উপাদানের পুনরাবৃত্তি সেটি অনুসরণ করে নির্দেশ করা যেতে পারে
একটি সংখ্যাসূচক মান সহ উপাদান বা বন্ধনীর মধ্যে একটি সংখ্যাসূচক ব্যাপ্তি। উদাহরণ:
x(3) xxx এর সাথে মিলে যায়, x(2,4) xx বা xxx বা xxxx এর সাথে মিলে যায়। যখন একটি
প্যাটার্নটি একটি সিকোয়েন্সের N- বা C-টার্মিনালের মধ্যে সীমাবদ্ধ, সেই প্যাটার্ন
হয় একটি '<' চিহ্ন দিয়ে শুরু হয় বা যথাক্রমে একটি '>' চিহ্ন দিয়ে শেষ হয়। একটি পিরিয়ড শেষ হয়
নমুনা. (fuzztran এ ঐচ্ছিক)। উদাহরণস্বরূপ, [DE](2)HS{P}X(2)PX(2,4)C

অতিরিক্ত অধ্যায়
-ফ্রেম তালিকা
ডিফল্ট মান: 1

-টেবিল তালিকা

আউটপুট অধ্যায়
-আউটফাইল রিপোর্ট

onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে fuzztrane ব্যবহার করুন