āĻāĻāĻŋ āĻšāĻ˛ geneparse-mpi āĻāĻŽāĻžāĻ¨ā§āĻĄ āĻ¯āĻž āĻāĻŽāĻžāĻĻā§āĻ° āĻāĻāĻžāĻ§āĻŋāĻ āĻŦāĻŋāĻ¨āĻžāĻŽā§āĻ˛ā§āĻ¯ā§āĻ° āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ āĻāĻ¯āĻŧāĻžāĻ°ā§āĻāĻ¸ā§āĻā§āĻļāĻ¨ āĻ¯ā§āĻŽāĻ¨ āĻāĻŦā§āĻ¨ā§āĻā§ āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨, āĻĢā§āĻĄā§āĻ°āĻž āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨, āĻāĻāĻ¨ā§āĻĄā§āĻ āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ āĻāĻŽā§āĻ˛ā§āĻāĻ° āĻŦāĻž MAC OS āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ āĻāĻŽā§āĻ˛ā§āĻāĻ° āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°ā§ OnWorks āĻĢā§āĻ°āĻŋ āĻšā§āĻ¸ā§āĻāĻŋāĻ āĻĒā§āĻ°āĻĻāĻžāĻ¨āĻāĻžāĻ°ā§āĻ¤ā§ āĻāĻžāĻ˛āĻžāĻ¨ā§ āĻ¯ā§āĻ¤ā§ āĻĒāĻžāĻ°ā§āĨ¤
āĻāĻžāĻ°ā§āĻ¯āĻā§āĻ°āĻŽ:
NAME āĻāĻ°
geneparse - āĻ¸āĻŋāĻā§āĻ¯āĻŧā§āĻ¨ā§āĻ¸ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ āĻ˛ā§āĻĄāĻžāĻ° āĻĢā§āĻ°āĻ¨ā§āĻāĻāĻ¨ā§āĻĄ
āĻ¸āĻŋāĻ¨āĻžāĻĒāĻ¸ā§
geneparse [options...] [input] [input2...] #āĻāĻ¨āĻĒā§āĻ āĻĒāĻĄāĻŧā§āĻ¨ āĻāĻŦāĻ stdout āĻ āĻ˛āĻŋāĻā§āĻ¨
āĻŦāĻ°ā§āĻŖāĻ¨āĻžāĻ
āĻāĻāĻāĻŋ āĻā§āĻ°āĻŽ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ āĻĒāĻĄāĻŧā§ āĻāĻŦāĻ āĻāĻāĻŋ āĻā§āĻĨāĻžāĻ āĻ˛āĻŋāĻā§ (āĻĄāĻŋāĻĢāĻ˛ā§āĻāĻ°ā§āĻĒā§ stdout āĻĨā§āĻā§)āĨ¤
āĻāĻāĻāĻŋ āĻāĻ¨āĻĒā§āĻ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ā§āĻ° āĻŽāĻ§ā§āĻ¯ā§ āĻāĻāĻāĻŋ āĻ¨āĻŋāĻ°ā§āĻĻāĻŋāĻˇā§āĻ āĻĒāĻ°āĻŋāĻ¸āĻ° āĻĢāĻžāĻāĻ˛ [āĻļā§āĻ°ā§, āĻĨāĻžāĻŽ] āĻĻā§āĻŦāĻžāĻ°āĻž āĻ¨āĻŋāĻ°ā§āĻĻāĻŋāĻˇā§āĻ āĻāĻ°āĻž āĻ¯ā§āĻ¤ā§ āĻĒāĻžāĻ°ā§āĨ¤ āĻŦāĻ°ā§āĻ
āĻŦāĻ¨ā§āĻ§āĻ¨ā§āĻā§āĻ˛āĻŋ {[()]}, (āĻ¯ā§āĻŽāĻ¨ "genome.fa[3000,4000]" āĻŦāĻž
"genome.fa{3000~4000}")āĨ¤ āĻ¸āĻā§āĻ¤āĻ¨ āĻšā§āĻ¨ āĻ¯ā§ āĻ¸ā§āĻā§āĻ˛āĻŋāĻ° āĻ¸āĻŽāĻ¸ā§āĻ¤ āĻāĻĒāĻ¨āĻžāĻ° āĻļā§āĻ˛ āĻĻā§āĻŦāĻžāĻ°āĻž āĻĒāĻžāĻ°ā§āĻ¸ āĻāĻ°āĻž āĻšāĻ¤ā§ āĻĒāĻžāĻ°ā§āĨ¤ āĻāĻāĻžāĻĄāĻŧāĻžāĻ
āĻ¯ā§āĻā§āĻ¨ āĻ -āĻļāĻŦā§āĻĻ āĻ āĻā§āĻˇāĻ° āĻ¸āĻāĻā§āĻ¯āĻž āĻāĻ˛āĻžāĻĻāĻž āĻāĻ°āĻ¤ā§ āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°āĻž āĻ¯ā§āĻ¤ā§ āĻĒāĻžāĻ°ā§āĨ¤
āĻŦāĻŋāĻāĻ˛ā§āĻĒ
--āĻ°āĻŋāĻĒāĻŋāĻāĻŽāĻžāĻ¸ā§āĻ|-āĻāĻ°
āĻ¸āĻĢā§āĻ-āĻ°āĻŋāĻĒāĻŋāĻāĻŽāĻžāĻ¸ā§āĻāĻĄ āĻ¸āĻŋāĻā§āĻ¯āĻŧā§āĻ¨ā§āĻ¸ āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°ā§āĻ¨ (āĻ¯ā§āĻŽāĻ¨: āĻā§āĻ āĻšāĻžāĻ¤ā§āĻ° āĻāĻžāĻāĻāĻŋ N āĻāĻ° āĻ¸āĻžāĻĨā§ āĻĒā§āĻ°āĻ¤āĻŋāĻ¸ā§āĻĨāĻžāĻĒāĻ¨ āĻāĻ°ā§āĻ¨)āĨ¤
--āĻāĻĒāĻ°|--āĻŽā§āĻā§āĻļ āĻā§āĻ˛ā§āĻ¨|-āĻāĻ
āĻŦāĻĄāĻŧ āĻšāĻžāĻ¤ā§āĻ° āĻ¸āĻŦ āĻŦā§āĻ¸āĨ¤
--āĻĻā§āĻ°ā§āĻā§āĻ¯|-l
āĻļā§āĻ§ā§ āĻĻā§āĻ°ā§āĻā§āĻ¯ āĻĒā§āĻ°āĻŋāĻ¨ā§āĻ āĻāĻ°ā§āĻ¨ āĻāĻŦāĻ āĻĒā§āĻ°āĻ¸ā§āĻĨāĻžāĻ¨ āĻāĻ°ā§āĻ¨
--āĻĒāĻ°āĻŋāĻˇā§āĻāĻžāĻ°|-āĻ
āĻļā§āĻˇ āĻšāĻ˛ā§ āĻāĻāĻāĻŋ āĻ¨āĻ¤ā§āĻ¨ āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ āĻ¯ā§āĻ āĻāĻ°āĻŦā§āĻ¨ āĻ¨āĻž
--āĻ¸āĻāĻ¸ā§āĻāĻ°āĻŖ|-āĻāĻŋ
āĻĒā§āĻ°ā§āĻā§āĻ°āĻžāĻŽ āĻ¸āĻāĻ¸ā§āĻāĻ°āĻŖ āĻĒā§āĻ°āĻŋāĻ¨ā§āĻ āĻāĻ°ā§
--āĻšā§āĻ˛ā§āĻĒ|-āĻ
āĻāĻāĻāĻŋ āĻ¸āĻžāĻšāĻžāĻ¯ā§āĻ¯ āĻŦāĻžāĻ°ā§āĻ¤āĻž āĻĒā§āĻ°āĻŋāĻ¨ā§āĻ āĻāĻ°ā§
--āĻāĻāĻāĻĒā§āĻ|-āĻ
āĻāĻāĻāĻŋ āĻĢāĻžāĻāĻ˛ā§ āĻāĻāĻāĻĒā§āĻ āĻĒāĻžāĻ āĻžāĻ¨ (āĻ āĻ¨ā§āĻ¯āĻĨāĻžāĻ¯āĻŧ stdout āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°ā§āĻ¨)āĨ¤ --āĻāĻāĻāĻĒā§āĻ āĻŦā§āĻāĻžāĻ¯āĻŧ --āĻĒāĻ°āĻŋāĻˇā§āĻāĻžāĻ°āĨ¤
--āĻļāĻžāĻ¨ā§āĻ¤|-āĻĒā§āĻ°
āĻ¸āĻŽāĻ¸ā§āĻ¤ āĻ¸āĻ¤āĻ°ā§āĻāĻ¤āĻž āĻ¨ā§āĻ°āĻŦ āĻāĻ°ā§āĻ¨
--āĻāĻžāĻ°āĻŦā§āĻ¸|-āĻāĻŋ
āĻĒā§āĻ°āĻā§āĻ° āĻ āĻ¤āĻŋāĻ°āĻŋāĻā§āĻ¤ āĻŦāĻŋāĻŦāĻ°āĻŖ āĻĒā§āĻ°āĻŋāĻ¨ā§āĻ āĻāĻ°ā§
onworks.net āĻĒāĻ°āĻŋāĻˇā§āĻŦāĻž āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°ā§ āĻ āĻ¨āĻ˛āĻžāĻāĻ¨ā§ geneparse-mpi āĻŦā§āĻ¯āĻŦāĻšāĻžāĻ° āĻāĻ°ā§āĻ¨