এটি হল gt-chseqids কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
gt-chseqids - একটি ম্যাপিং ফাইলে দেওয়া ম্যাপিং দ্বারা ক্রম আইডি পরিবর্তন করুন।
সাইনোপিসিস
gt chseqids [বিকল্প...] ম্যাপিং_ফাইল [GFF3_file]
বর্ণনাঃ
-সাজান [হ্যাঁ|না]
সিকোয়েন্স আইডি পরিবর্তন করার পরে GFF3 বৈশিষ্ট্যগুলি সাজান (মেমরি খরচ হয়
ইনপুট ফাইলের আকারের সমানুপাতিক) (ডিফল্ট: না)
-v [হ্যাঁ|না]
শব্দযুক্ত হতে (ডিফল্ট: না)
-o [ফাইলের নাম]
নির্দিষ্ট ফাইলে আউটপুট পুনঃনির্দেশিত (ডিফল্ট: অনির্ধারিত)
-জিজিপ [হ্যাঁ|না]
gzip সংকুচিত আউটপুট ফাইল লিখুন (ডিফল্ট: না)
-bzip2 [হ্যাঁ|না]
bzip2 সংকুচিত আউটপুট ফাইল লিখুন (ডিফল্ট: না)
- বল [হ্যাঁ|না]
আউটপুট ফাইলে জোর করে লেখা (ডিফল্ট: না)
-হেল্প
সাহায্য প্রদর্শন এবং প্রস্থান
-version
সংস্করণ তথ্য প্রদর্শন করুন এবং প্রস্থান করুন
ম্যাপিং_ফাইলের জন্য ফাইল বিন্যাস:
সরবরাহকৃত ম্যাপিং ফাইলটি "chseqids" নামে একটি ম্যাপিং টেবিল সংজ্ঞায়িত করে। এটা মানচিত্র
GFF3_file-এ অন্যান্য নামে প্রদত্ত ক্রম-অঞ্চল এন্ট্রি। এটি হিসাবে সংজ্ঞায়িত করা যেতে পারে
অনুসরণ:
chseqids = {
chr1 = "seq1",
chr2 = "seq2"
}
যখন এই উদাহরণটি ব্যবহার করা হয়, তখন সমস্ত সিকোয়েন্স আইডি "chr1" পরিবর্তন করে "seq1" করা হবে এবং সমস্ত
সিকোয়েন্স আইডি "chr2" থেকে "seq2"।
প্রতিবেদনের বাগ
বাগ রিপোর্ট করুন[ইমেল সুরক্ষিত]>.
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে gt-chseqids ব্যবহার করুন
