এটি হল load_genbankp কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
load_genbank.pl - GENBANK ফাইল থেকে একটি Bio::DB::GFF ডাটাবেস লোড করুন।
সাইনোপিসিস
% load_genbank.pl -d genbank -f localfile.gb
% load_genbank.pl -d genbank -a AP003256
দ্রষ্টব্য: BioPerl ডিস্ট্রিবিউশনে bp_genbank2gff.pl স্ক্রিপ্ট এই স্ক্রিপ্টের মতোই।
বর্ণনাঃ
এই স্ক্রিপ্টটি একটি বায়ো::ডিবি::জিএফএফ ডাটাবেস লোড করে যা স্থানীয়
genbank ফাইল বা একটি অ্যাক্সেস যা genbank থেকে আনা হয়। বিভিন্ন কমান্ড-লাইন বিকল্প
কোন ডাটাবেস লোড করতে হবে এবং একটি বিদ্যমান ডাটাবেসকে অনুমতি দিতে হবে কিনা তা নিয়ন্ত্রণ করতে আপনাকে অনুমতি দেয়
ওভাররাইট করা
এই স্ক্রিপ্টটি বর্তমানে শুধুমাত্র MySQL ব্যবহার করে, যদিও এটি একটি প্রুফ-অফ- নীতি এবং সহজেই হতে পারে
অ্যাডাপ্টরের মাধ্যমে GFF দ্বারা সমর্থিত অন্যান্য RDMS-এর সাথে কাজ করার জন্য প্রসারিত করা হবে।
কম্যান্ড-লাইন বিকল্প
কমান্ড-লাইন বিকল্পগুলিকে একক-অক্ষর বিকল্পগুলিতে সংক্ষেপিত করা যেতে পারে। যেমন -d এর পরিবর্তে
--তথ্যশালা.
-- ফোর্স তৈরি করুন এবং ডাটাবেস শুরু করুন
--ডিএসএন ডেটা উৎস (ডিফল্ট dbi:mysql:test)
-- ব্যবহারকারী MySQL প্রমাণীকরণের জন্য ব্যবহারকারীর নাম
--পাস MySQL প্রমাণীকরণের জন্য পাসওয়ার্ড
--প্রক্সি দূরবর্তী অ্যাক্সেসের জন্য ব্যবহার করার জন্য প্রক্সি সার্ভার
--ফাইল আর্গুমেন্টগুলি যেগুলি অনুসরণ করে তা হল Genbank/EMBL ফাইলের নাম (ডিফল্ট)
--অ্যাক্সিশন আর্গুমেন্ট যা অনুসরণ করে তা হল জেনব্যাঙ্ক অ্যাকসেসন নম্বর
--stdout লোড করার পরিবর্তে রূপান্তরিত GFF ফাইলটিকে stdout-এ লিখুন
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে load_genbankp অনলাইন ব্যবহার করুন
