এটি হল masai_mapper কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
masai_mapper - মাসাই ম্যাপার
সাইনোপিসিস
মাসাই_ম্যাপার [বিকল্প]
বর্ণনাঃ
মাসাই আনুমানিক বীজ এবং একাধিক ভিত্তিক একটি দ্রুত এবং সঠিক পঠিত ম্যাপার
ব্যাকট্র্যাকিং
দেখ http://www.seqan.de/projects/masai আরও তথ্যের জন্য.
(c) কপিরাইট 2011-2012 Enrico Siragusa দ্বারা।
-h, --help
এই সাহায্য বার্তা প্রদর্শন করে.
--সংস্করণ
সংস্করণ তথ্য প্রদর্শন করুন
ম্যাপিং বিকল্প:
-মিমি, --ম্যাপিং-মোড STR
ম্যাপিং মোড নির্বাচন করুন। সকলের মধ্যে একটি, সর্বোত্তম, এবং যেকোন-উত্তম। ডিফল্ট: যেকোনো-সেরা।
-এমবি, --ম্যাপিং-ব্লক NUM টি
একবারে ম্যাপ করার জন্য সর্বাধিক পঠিত সংখ্যা৷ পরিসরে [10000..inf]। ডিফল্ট:
2147483647.
-e, --ত্রুটি NUM টি
প্রতি পড়া ত্রুটির সর্বোচ্চ সংখ্যা. পরিসরে [0..32]। ডিফল্ট: 5।
-sl, --বীজ-দৈর্ঘ্য NUM টি
ন্যূনতম বীজ দৈর্ঘ্য। পরিসরে [10..100]। ডিফল্ট: 33।
-এনজি, --নো-ফাঁক
ফাঁক দিয়ে পড়া সারিবদ্ধ করবেন না।
জিনোম সূচক বিকল্প:
-x, --সূচক STR
জিনোম সূচকের ধরন নির্বাচন করুন। esa, sa, qgram, এবং fm এর মধ্যে একটি। ডিফল্ট: sa.
এক্সপ্রেস, --সূচী-উপসর্গ STR
একটি জিনোম সূচক উপসর্গ নাম উল্লেখ করুন। ডিফল্ট: জিনোম ফাইলের নাম উপসর্গ ব্যবহার করুন।
আউটপুট বিকল্প:
-o, --আউটপুট ফাইল ফাইল
একটি আউটপুট ফাইল নির্দিষ্ট করুন। ডিফল্ট: রিডস ফাইলের নাম উপসর্গ ব্যবহার করুন। বৈধ ফাইল প্রকার
হল: কাঁচা এবং স্যাম।
-এনসি, --না-সিগার
CIGAR স্ট্রিং আউটপুট করবেন না। এটি শুধুমাত্র SAM আউটপুটকে প্রভাবিত করে।
ডিবাগ বিকল্প:
-nv, --না-যাচাই
বীজ হিট যাচাই করবেন না।
-nd, --না-ডাম্প
ফলাফল ডাম্প করবেন না।
-এনএম, --না-একাধিক
একাধিক ব্যাকট্র্যাকিং অক্ষম করুন।
সংস্করণ
masai_mapper সংস্করণ: 0.7.1 [14053] সর্বশেষ আপডেট 2013-05-16
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে masai_mapper অনলাইন ব্যবহার করুন