এটি কমান্ড প্লটকোন যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
plotcon - একটি ক্রম প্রান্তিককরণের প্লট সংরক্ষণ
সাইনোপিসিস
প্লটকন - ক্রম seqset [-স্কোরফাইল জরায়ু] -উইনসাইজ পূর্ণসংখ্যা -চিত্রলেখ xygraph
প্লটকন -হেল্প
বর্ণনাঃ
প্লটকন এটি EMBOSS এর একটি কমান্ড লাইন প্রোগ্রাম ("ইউরোপীয় আণবিক জীববিজ্ঞান ওপেন
সফটওয়্যার স্যুট"). এটি "সারিবদ্ধকরণ: একাধিক" কমান্ড গ্রুপ(গুলি) এর অংশ।
বিকল্প
ইনপুট অধ্যায়
- ক্রম seqset
একটি ক্রম প্রান্তিককরণ ধারণকারী ফাইল
-স্কোরফাইল জরায়ু
এটি স্কোরিং ম্যাট্রিক্স ফাইল যা ক্রম তুলনা করার সময় ব্যবহৃত হয়। ডিফল্টরূপে এটি
ফাইল 'EBLOSUM62' (প্রোটিনের জন্য) অথবা ফাইল 'EDNAFULL' (নিউক্লিক সিকোয়েন্সের জন্য)। এইগুলো
ফাইলগুলি EMBOSS ইনস্টলেশনের 'ডেটা' ডিরেক্টরিতে পাওয়া যায়।
প্রয়োজনীয় অধ্যায়
-উইনসাইজ পূর্ণসংখ্যা
গড় প্রান্তিককরণ গুণমানে কলামের সংখ্যা। বৃহত্তর এই মান,
প্লট মসৃণ হবে. ডিফল্ট মান: 4
আউটপুট অধ্যায়
-চিত্রলেখ xygraph
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে প্লটকোন ব্যবহার করুন
