এটি হল pynifti_pst কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
pynifti_pst - fMRI ডেটার পেরিস্টিমুলাস টাইমসিরিজ গণনা করুন
সাইনোপিসিস
pynifti_pst [অপশন] <4 চিত্র> <vol_id | ফাইলের নাম> [...]
বর্ণনাঃ
pynifti_pst একটি ভলিউমে সমস্ত ভক্সেলের জন্য পেরিস্টিমুলাস সিগন্যাল টাইমকোর্স গণনা করে
একদা. উদ্দীপক অনসেটগুলি ভলিউম সংখ্যা বা সময় হিসাবে নির্দিষ্ট করা যেতে পারে (এ রূপান্তরিত হবে
একটি সরবরাহকৃত পুনরাবৃত্তির সময় ব্যবহার করে ভলিউম সংখ্যা)। onsets সরাসরি নির্দিষ্ট করা যেতে পারে
কমান্ড লাইন, তবে (একাধিক) ফাইল থেকেও পড়া যায়। এই ধরনের ফাইল তালিকা অনুমান করা হয়
প্রতি লাইনে একটি সূচনা (প্রথম মান হিসাবে)। খালি লাইন উপেক্ষা করা হয়. এটি pynifti_pst সক্ষম করে
যেমন FSL এর কাস্টম ইভি ফাইল ব্যবহার করতে। যদি বেশ কয়েকটি ফাইল নির্দিষ্ট করা থাকে, তাহলে রিড অনসেট হয়
একটি একক সূচনা ভেক্টরের সাথে মিলিত। pynifti_pst আউটপুট হিসাবে একটি 4d টাইমসিরিজ ইমেজ লেখে।
প্রতিটি ভক্সেল সিগন্যাল টাইমকোর্স দেখার জন্য এই ছবিটি FSLView এ লোড করা যেতে পারে
শুধুমাত্র এটি ক্লিক করে নির্দিষ্ট শর্ত.
বিকল্প
--সংস্করণ
প্রোগ্রামের সংস্করণ নম্বর দেখান এবং প্রস্থান করুন
-h, --help
এই সাহায্য বার্তাটি দেখান এবং প্রস্থান করুন
-- ভারবোস
অবস্থা বার্তা মুদ্রণ
-n NVOLS, --এনভোলস=NVOLS
গণনাকৃত পেরিস্টিমুলাস সিগন্যাল টাইমকোর্সের দৈর্ঘ্য সেট করুন (ভলিউমে)।
ডিফল্ট: 10 X
-t, --বার
যদি সরবরাহ করা হয়, পঠিত মানগুলিকে শুরুর সময় হিসাবে গণ্য করা হয় এবং এতে রূপান্তরিত করা হবে
ভলিউম সংখ্যা প্রতিটি শুরুর জন্য সময়ের সবচেয়ে কাছাকাছি ভলিউম নির্বাচন করা হবে।
ভলিউমগুলি tr/2 এর পরে ঠিক (এবং সম্পূর্ণরূপে) রেকর্ড করা হয়েছে বলে ধরে নেওয়া হয়, যেমন যদি
'tr' হল 2 সেকেন্ডের প্রথম ভলিউমটি ঠিক এক সেকেন্ডে রেকর্ড করা হয়েছে। অনুগ্রহ করে দেখুন
--tr এবং --অফসেট রূপান্তর সামঞ্জস্য কিভাবে শেখার বিকল্প.
--tr=TR
4d চিত্রের পুনরাবৃত্তির সময় (পরপর দুটি ভলিউমের সাময়িক পার্থক্য)।
এটি 4d ছবিতে সেটিংস ওভাররাইড করতে ব্যবহার করা যেতে পারে। পুনরাবৃত্তির সময় হল
শুরুর সময়কে ভলিউম সংখ্যায় রূপান্তর করতে প্রয়োজনীয়। যদি '--times' অপশন থাকে
এই মান সেট না কোন প্রভাব আছে. অনুগ্রহ করে নোট করুন যে পুনরাবৃত্তির সময় এবং
সরবরাহকৃত সূচনা একই ইউনিটে হতে হবে। দয়া করে নোট করুন, যে যদি --বার দেওয়া হয়
tr-কে একই ইউনিটে উল্লেখ করতে হবে যেটি পঠিত শুরুর সময়।
--অফসেট=OFFSET
ভলিউম সংখ্যায় রূপান্তর করার সময় অনসেট সময়ে প্রয়োগ করা ধ্রুবক অফসেট।
'--বার' সেট না করে এই বিকল্পের কোন প্রভাব নেই'।
-p, --percsigchg
গণনা করা টাইমকোর্সকে প্রথমের তুলনায় শতাংশ সংকেত পরিবর্তনে রূপান্তর করুন
(শুরু) ভলিউম। এই যখন অর্থপূর্ণ নাও হতে পারে --অপারেশন কিছু সেট করা হয়
'মানে' থেকে ভিন্ন। অনুগ্রহ করে নোট করুন, যে আকার টাইমসিরিজ গণনা করে
প্রথম গড় ভলিউমের উপর ব্যাপকভাবে নির্ভর করে। এটি a ব্যবহার করা আরও অর্থপূর্ণ হতে পারে
মূল হিসাবে বাস্তব বেসলাইন অবস্থা। যাইহোক, এটি এখনও সমর্থিত নয়। ডিফল্ট:
মিথ্যা
--প্রিন্টভক্সেল=প্রিন্টভক্সেল
সমস্ত শুরুর জন্য আলাদাভাবে একটি একক ভক্সেলের পেরিস্টিমুলাস টাইমসিরিজ প্রিন্ট করুন। এই
একটি ম্যাট্রিক্স (অনুসেট x সময়) প্রিন্ট করবে, যেখানে কলামের সংখ্যা একই রকম
মুল্য --এনভোলস এবং সারির সংখ্যা নির্দিষ্ট করা সংখ্যার সাথে মিলে যায়
শুরু (যেমন 'z,y,x')
--অপারেশন=অপারেশন
পেরিস্টিমুলাস টাইমসিরিজ গণনা করার জন্য সঞ্চালিত গণিত অপারেশন চয়ন করুন।
ডিফল্টরূপে এটি সমস্ত উদ্দীপনা জুড়ে গড় ('মানে')। অন্যান্য সম্ভাবনার
মানক বিচ্যুতি ('std') এবং আদর্শ ত্রুটি ('sde')।
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে pynifti_pst ব্যবহার করুন
