এটি হল ইউজিন কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
UGENE - ইন্টিগ্রেটেড বায়োইনফরমেটিক্স স্যুট
সাইনোপিসিস
ইউজিন -উই
ইউজিন [বিকল্প]
বর্ণনাঃ
UGENE ডিএনএ এবং প্রোটিন ক্রম বিশ্লেষণের জন্য একটি ক্রস-প্ল্যাটফর্ম পরিবেশ। UGENE
সবচেয়ে জনপ্রিয় বায়োইনফরমেটিক্স কম্পিউটেশনাল অ্যালগরিদমগুলিকে একীভূত করে এবং উভয় GUI প্রদান করে
এবং জিনোমিক ডেটার জটিল বিশ্লেষণ করার জন্য কমান্ড লাইন ইন্টারফেস।
এর প্রধান বৈশিষ্ট্য UGENE:
* টীকাযুক্ত ডিএনএ বা প্রোটিন ক্রম দেখুন এবং বিশ্লেষণ করুন
* ক্রোমাটোগ্রাম ভিজ্যুয়ালাইজেশন এবং সম্পাদনা
* PDB এবং MMDB ফর্ম্যাটে ফাইলগুলির জন্য ইন্টিগ্রেটেড 3D ভিউয়ার
* NCBI ডাটাবেসে অনুসন্ধানের অনুরোধের সমন্বিত সমর্থন
* MUSCLE3, MUSCLE4 এবং KAlign ব্যবহার করে একাধিক ক্রম সারিবদ্ধকরণ
* HMM প্রোফাইলগুলি HMMER2 এবং HMMER3 এর উত্সের উপর ভিত্তি করে তৈরি এবং অনুসন্ধান করে৷
* GORIV এবং PsiPred এর উপর ভিত্তি করে আধুনিক প্রোটিন সেকেন্ডারি স্ট্রাকচার পূর্বাভাস অ্যালগরিদম
* ফিলিপের সাথে ফিলোজেনেটিক বিশ্লেষণ
* Primer3 প্যাকেজ ব্যবহার করে PCR প্রাইমার ডিজাইন
* সিলিকোতে ক্লোনিং
* SITECON ব্যবহার করে DNA সিকোয়েন্সে ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর বাইন্ডিং সাইট অনুসন্ধান করুন
* সীমাবদ্ধতা এনজাইম এবং REBASE এর সাথে একীকরণের জন্য অনুসন্ধান করুন
* সরাসরি এবং বিপরীত পুনরাবৃত্তির জন্য অনুসন্ধান করুন
* বোটি ব্যবহার করে ডিএনএ রেফারেন্স সমাবেশ
* প্রোটিন ব্যাক অনুবাদ
* ORF-এর জন্য অনুসন্ধান করুন
* জটিল গণনামূলক কর্মপ্রবাহ এবং প্রশ্নের জন্য ডিজাইনার
UGENE মডুলার গঠন আছে এবং এর প্রায় সমস্ত কার্যকারিতা প্লাগইনের মধ্যে আসে।
অন্ত UGENE ব্যবহার থেকে লাভ করতে সমান্তরাল সমর্থনের সাথে ডিজাইন করা হয়েছে
মাল্টিকোর কম্পিউটার। প্রতিটি গণনামূলক কাজ ইন UGENE ব্যাকগ্রাউন্ডে সঞ্চালিত হয় এবং করে
গ্রাফিকাল ইন্টারফেসের সাথে ব্যবহারকারীর মিথস্ক্রিয়া ব্লক করবেন না।
বিকল্প
-উই এর GUI সংস্করণ চালান UGENE
--help সমস্ত কমান্ড-লাইন বিকল্প এবং প্রোগ্রামের সংক্ষিপ্তসারে একটি ব্যবহার বার্তা প্রিন্ট করুন
সংস্করণ, তারপর প্রস্থান করুন।
--লাইসেন্স
ডাম্প লাইসেন্স তথ্য
--টাস্ক= or স্কিমা-নাম> [স্কিমা-বিকল্প]
প্রদত্ত ওয়ার্কফ্লো স্কিমা চালান
--স্থিতি-বার-লুকান
টাস্ক স্ট্যাটাস বার দেখাবেন না
--ini-ফাইল=
কাস্টম UGENE সেটিংস ফাইল লোড করুন
--লগ-নো-শো-লেভেল
লগ এ বার্তা স্তর দেখান না
--লগ-নো-শো-তারিখ
লগে তারিখ ও সময় তথ্য দেখাবেন না
--লগ-নো-শো-বিভাগ
লগ এ বার্তা বিভাগ দেখাবেন না
--লগ-লেভেল-ট্রেস
ট্রেস লগ বার্তা দেখান
--লগ-লেভেল-কোনটি নয়
লগ মেসেজ দেখাবেন না
--লগ-লেভেল-তথ্য
ত্রুটি এবং তথ্য লগ বার্তা দেখান (ডিফল্ট)
--লগ-লেভেল-ত্রুটি
শুধুমাত্র ত্রুটি লগ বার্তা দেখান
--লগ-লেভেল-বিশদ বিবরণ
বিস্তারিত লগ বার্তা দেখান
--লগ-রঙ-আউটপুট
রঙিন আউটপুট বার্তা
--টাস্ক-রিমোট-মেশিন=
প্রদত্ত রিমোট মেশিনে প্রদত্ত কাজগুলি চালান
--উজিন-বেঁচে থাকুন
প্রদত্ত কাজগুলি শেষ করার পরে ইউজিন বন্ধ করবেন না
--অনুবাদ=
নির্দিষ্ট ভাষার অনুবাদ লোড করুন। ভাষা একটি দুই-অক্ষর ISO হিসাবে নির্দিষ্ট করা হয়
639 ভাষার কোড
কম্যান্ডস
UGENE সবচেয়ে উল্লেখযোগ্য বৈশিষ্ট্যের জন্য কমান্ড আছে. কমান্ড হিসাবে চালানো যেতে পারে
ইউজিন [কমান্ড-আর্গুমেন্টস]
ইউজিন --টাস্ক= [কমান্ড-আর্গুমেন্টস]
চলমান প্রতিটি কমান্ডের জন্য সহায়তা দেখুন ইউজিন --সহায়তা= .
উপলব্ধ কমান্ডের তালিকা ব্যবহার করে ডাম্প করা যেতে পারে ইউজিন -- সাহায্য
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইন ইউজিন ব্যবহার করুন
