এটি হল xcrysden কমান্ড যা আমাদের একাধিক বিনামূল্যের অনলাইন ওয়ার্কস্টেশন যেমন উবুন্টু অনলাইন, ফেডোরা অনলাইন, উইন্ডোজ অনলাইন এমুলেটর বা MAC OS অনলাইন এমুলেটর ব্যবহার করে OnWorks ফ্রি হোস্টিং প্রদানকারীতে চালানো যেতে পারে।
কার্যক্রম:
NAME এর
xcrysden - স্ফটিক এবং আণবিক গঠন ভিজ্যুয়ালাইজার
সাইনোপিসিস
xcrysden [বিশেষ বিকল্প]
xcrysden [বিশেষ বিকল্প] বিন্যাস-বিকল্প ফাইল|ডিরেক্টরি
বর্ণনাঃ
XCrySDen একটি স্ফটিক এবং আণবিক কাঠামো ভিজ্যুয়ালাইজেশন প্রোগ্রাম, যার লক্ষ্য
আইসোসারফেস এবং কনট্যুরগুলির প্রদর্শন, যা স্ফটিক কাঠামোর উপর চাপানো যেতে পারে
এবং ইন্টারেক্টিভভাবে ঘোরানো এবং ম্যানিপুলেটেড।
বিশেষ বিকল্প
-h
--help
সাহায্য বার্তা প্রদর্শন করুন।
-v
--সংস্করণ
প্রোগ্রাম সংস্করণ তথ্য প্রদর্শন.
-u id
-- ব্যবহার id
উইন্ডো-আইডি= সহ কন্টেইনার উইন্ডোতে এম্বেড করা XCrySDen লোড করুনid.
-r অস্পষ্ট
--কমানো অস্পষ্ট
XSF ফাইলের পর্যায়ক্রমিক মাত্রা হ্রাস করুন অস্পষ্ট. আগে উল্লেখ করতে হবে --এক্সএসএফ বিকল্প,
যেমন, xcrysden -r 2 --এক্সএসএফ ফাইল.
-c ফাইল
-- কাস্টম ফাইল
একটি নির্দিষ্ট ফাইল থেকে কাস্টম-সংজ্ঞা লোড করুন (সিনট্যাক্স হল এর
~/.xcrysden/custom-definitions).
-a ফাইল
-- বৈশিষ্ট্য ফাইল
ফাইল থেকে বৈশিষ্ট্য লোড করুন। বৈশিষ্ট্য ফাইলের বিন্যাস নিম্নরূপ:
এলিমেন্টরং
পারমাণবিক-সংখ্যা 1 red1 blue1 green1
পারমাণবিক-সংখ্যা 2 red2 blue2 green2
...
ELEMENTRADIUS
পারমাণবিক-সংখ্যা 1 ব্যাসার্ধ 1
পারমাণবিক-সংখ্যা 2 ব্যাসার্ধ 2
...
-l ফাইল
--আলো ফাইল
XCrySDen এর লাইট ফরম্যাট করা ফাইল থেকে লাইট প্যারামিটার লোড করুন।
বিন্যাসে বিকল্প
--এক্সএসএফ ফাইল
XCrySDen-এর-স্ট্রাকচার-ফাইল (XSF) ফর্ম্যাট করা ফাইল থেকে কাঠামো লোড করুন।
--animxsf ফাইল
--axsf ফাইল
Animated-XCrySDen's-Structure-File (AXSF) ফরম্যাটেড ফাইল থেকে স্ট্রাকচার লোড করুন।
--bxsf ফাইল
BXSF (Band-XSF) ফাইল থেকে ব্যান্ড লোড করুন এবং ফার্মি সারফেস কল্পনা করুন।
--xmol ফাইল
--xyz ফাইল
XYZ ফর্ম্যাট করা ফাইল থেকে কাঠামো লোড করুন।
--পিডিবি ফাইল
PDB ফরম্যাট করা ফাইল থেকে কাঠামো লোড করুন।
--gzmat ফাইল
গাউসিয়ান জেড-ম্যাট্রিক্স থেকে কাঠামো লোড করুন (ওপেন-ব্যাবেল প্রোগ্রাম প্রয়োজন)।
--গাউসিয়ান_আউট ফাইল
--gxx_out ফাইল
--g98_out ফাইল
গাউসিয়ান আউটপুট ফাইল থেকে কাঠামো লোড করুন। শুধুমাত্র একক পয়েন্ট গণনা এবং
অপ্টিমাইজেশান রান এ পর্যন্ত সমর্থিত। অপ্টিমাইজেশান চালানোর জন্য এটি সম্ভব
রানের সময় উত্পাদিত সমস্ত কাঠামো রেন্ডার করুন।
--কিউব ফাইল
--gXX_কিউব ফাইল
--g98_কিউব ফাইল
গাউসিয়ান কিউব ফাইল থেকে কাঠামো লোড করুন। কিউব ফাইলটি দিয়ে তৈরি করা উচিত
কিউব=কার্ড অপশন। শুধুমাত্র স্কেলার কিউব ফাইল সমর্থিত, অর্থাৎ, কিউব=(কার্ড, ঘনত্ব)
অথবা কিউব=(কার্ড, অরবিটাল) বা কিউব=(কার্ড, সম্ভাব্য)। এর জন্য গাউসিয়ান ম্যানুয়াল পড়ুন
এই কীওয়ার্ডের অর্থ।
--ক্রিস্টাল_ইনপি ফাইল
CRYSTAL থেকে কাঠামো লোড করুন (http://httpwww.crystal.unito.it/) ইনপুট ফাইল.
--ক্রিস্টাল_এফ৯ ফাইল
CRYSTAL থেকে কাঠামো লোড করুন (http://httpwww.crystal.unito.it/) fortran ইউনিট 9.
--wien_struct ফাইলহেড|ফাইল|ডিরেক্টরি
WIEN2k থেকে কাঠামো লোড করুন (http://www.wien2k.at/) struct-file, যেখানে:
ফাইলহেড = ছাড়া struct ফাইলের নাম .struct সম্প্রসারণ,
ফাইল = ফাইলের নাম,
ডিরেক্টরি = কেস ডিরেক্টরির নাম।
--wien_kpath ডিরেক্টরি|struct-ফাইল
পড়া struct হয় ফাইল করুন এবং বিশেষ k-পয়েন্ট সহ প্রথম Brillouin জোন রেন্ডার করুন। K-পথ হতে পারে
বিশেষ k-পয়েন্ট মাউস-ক্লিক করে ইন্টারেক্টিভভাবে নির্বাচন করা হয়। ব্যবহারকারীকে অবশ্যই উল্লেখ করতে হবে EMIN
এবং Emax শক্তি এবং পথ বরাবর k-পয়েন্টের মোট সংখ্যা। এই সংখ্যা নিছক
কে-পয়েন্টের মোট সংখ্যার একটি অনুমান, যেহেতু XCrySDen খুব ইউনিফর্ম পেতে চেষ্টা করে
পথ বরাবর k-পয়েন্টের নমুনা (WIEN2k সর্বোচ্চ অনুমোদিত সংখ্যক k- উল্লেখ করবেন না-
পয়েন্ট, যেহেতু XCrySDen আরও কয়েক পয়েন্ট তৈরি করতে পারে)।
--wien_renderdensity ডিরেক্টরি
পড়া struct হয়, আউটপুট, এবং Rho ফাইল এবং রেন্ডার স্ফটিক গঠন এবং precomputed
চার্জ ঘনত্ব।
--উইয়েন_ঘনত্ব নির্দেশিকা
চার্জ ঘনত্ব গণনার জন্য হয় 2D বা 3D অঞ্চলটি ইন্টারেক্টিভভাবে বেছে নেওয়া হয়
মাউস ক্লিক XCrySDen জেনারেট করে in5 ফাইল(গুলি), গণনা করে এবং চার্জের ঘনত্ব রেন্ডার করে
হয় আইসোলাইন/কালারপ্লেন (2D) বা আইসোসারফেস (3D) হিসাবে।
--wien_fermisurface ডিরেক্টরি
ফার্মি পৃষ্ঠ তৈরির জন্য একটি টাস্ক উইন্ডো পপ-আপ করুন। কয়েক ধাপ পর ফার্মি
পৃষ্ঠ (আশা করি) 3D আইসোসারফেস হিসাবে আঁকা হয়েছে।
--fhi_inpini ফাইল
FHI98MD থেকে কাঠামো লোড করুন inp.ini ফর্মেড ফাইল।
--fhi_coord ফাইল
FHI98MD থেকে কাঠামো লোড করুন coord.out ফর্মেড ফাইল।
--pwi
--pw_inp ফাইল
থেকে গঠন লোড pw.x ইনপুট ফাইল. pw.x একটি pseudopotential planwave প্রোগ্রাম
কোয়ান্টাম-এসপ্রেসো বিতরণ (http://www.quantum-espresso.org/).
--pwo
--pw_out ফাইল
থেকে গঠন লোড pw.x আউটপুট ফাইল. pw.x একটি pseudopotential planwave প্রোগ্রাম
কোয়ান্টাম-এসপ্রেসো বিতরণ (http://www.quantum-espresso.org/).
-s লিপি
--লিপি লিপি
Tcl স্ক্রিপ্ট ধারণকারী ফাইল থেকে স্ক্রিপ্ট লোড করুন।
onworks.net পরিষেবা ব্যবহার করে অনলাইনে xcrysden ব্যবহার করুন
