এটি codonPhyML নামের লিনাক্স অ্যাপ যার সর্বশেষ প্রকাশ codonPhyML_dev_1.00_201407.24.zip হিসাবে ডাউনলোড করা যেতে পারে। এটি ওয়ার্কস্টেশনের জন্য বিনামূল্যের হোস্টিং প্রদানকারী OnWorks-এ অনলাইনে চালানো যেতে পারে।
CodonPhyML নামের এই অ্যাপটি OnWorks সহ বিনামূল্যে অনলাইনে ডাউনলোড করুন এবং চালান।
এই অ্যাপটি চালানোর জন্য এই নির্দেশাবলী অনুসরণ করুন:
- 1. আপনার পিসিতে এই অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন৷
- 2. আমাদের ফাইল ম্যানেজারে প্রবেশ করুন https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনি যে ইউজারনেম চান।
- 3. এই ধরনের ফাইল ম্যানেজারে এই অ্যাপ্লিকেশনটি আপলোড করুন।
- 4. এই ওয়েবসাইট থেকে OnWorks Linux অনলাইন বা Windows অনলাইন এমুলেটর বা MACOS অনলাইন এমুলেটর শুরু করুন।
- 5. OnWorks Linux OS থেকে আপনি এইমাত্র শুরু করেছেন, আমাদের ফাইল ম্যানেজারে যান https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনার পছন্দের ব্যবহারকারীর নাম সহ।
- 6. অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন, এটি ইনস্টল করুন এবং এটি চালান।
স্ক্রীনশটগুলি
Ad
কোডনফাইএমএল
বর্ণনাঃ
কোডনফিএমএল ফাইলোজেনি পুনর্গঠনে বিবর্তনের মার্কোভিয়ান কোডন মডেল ব্যবহার করে। ইনপুট হিসাবে তাদের ডিএনএ সিকোয়েন্স দ্বারা চিহ্নিত প্রজাতির একটি সেট দেওয়া হলে, কোডনফিএমএল ফাইলোজেনেটিক ট্রি ফিরিয়ে দেবে যা তাদের বিবর্তনীয় সম্পর্ককে সর্বোত্তমভাবে বর্ণনা করে। কোডনফিএমএল বর্ণনাকারী আমাদের গবেষণাপত্রটি "আণবিক জীববিজ্ঞান এবং বিবর্তন" (MBE) জার্নালে প্রকাশিত হয়েছে। আরও বিস্তারিত জানার জন্য, লিঙ্কটি অনুসরণ করুন: http://mbe.oxfordjournals.org/content/30/6/1270. কোডনফিএমএল এমবিই-এর কভারে রয়েছে! এটি দেখুন (আগস্ট 2013): http://mbe.oxfordjournals.org/content/30/8.toc.CodonPhyML এর মাল্টিমডেল সংস্করণের জন্য, অনুগ্রহ করে 'codonphyml_multi.tgz' টারবল ব্যবহার করুন।
বৈশিষ্ট্য
- বিবর্তনের মার্কোভিয়ান কোডন মডেল: গোল্ডম্যান এবং ইয়াং 1994, মিউজ এবং গাট 1994, কোসিওল এট আল 2007, স্নাইডার এট আল 2005, ইয়াপ এট আল 2010
- এনএনআই এবং এসপিআর ট্রি টপোলজি অনুসন্ধান হিউরিস্টিক
- প্রতিস্থাপন হার পরামিতি সর্বাধিক সম্ভাবনা দ্বারা অনুমান
- OpenMP এর মাধ্যমে মাল্টিকোর সমর্থন
- বিভিন্ন মডেল জুড়ে তুলনীয় সম্ভাবনা (যেমন AA, NT এবং CODON)
পাঠকবর্গ
বিজ্ঞান/গবেষণা, শিক্ষা
ব্যবহারকারী ইন্টারফেস
কনসোল/টার্মিনাল, কমান্ড-লাইন
প্রোগ্রামিং ভাষা
C
এটি একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/codonphyml/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।
