এটি লিনাক্স অনলাইনে চালানোর জন্য Hierachical_DNAcoder নামের লিনাক্স অ্যাপ যার সর্বশেষ রিলিজ Sourcecode.zip হিসাবে ডাউনলোড করা যেতে পারে। এটি ওয়ার্কস্টেশনের জন্য বিনামূল্যের হোস্টিং প্রদানকারী OnWorks-এ অনলাইনে চালানো যেতে পারে।
ডাউনলোড করুন এবং অনলাইনে চালান Hierachical_DNAcoder নামের এই অ্যাপটি বিনামূল্যে OnWorks-এর সাথে লিনাক্সে চালানোর জন্য।
এই অ্যাপটি চালানোর জন্য এই নির্দেশাবলী অনুসরণ করুন:
- 1. আপনার পিসিতে এই অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন৷
- 2. আমাদের ফাইল ম্যানেজারে প্রবেশ করুন https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনি যে ইউজারনেম চান।
- 3. এই ধরনের ফাইল ম্যানেজারে এই অ্যাপ্লিকেশনটি আপলোড করুন।
- 4. এই ওয়েবসাইট থেকে OnWorks Linux অনলাইন বা Windows অনলাইন এমুলেটর বা MACOS অনলাইন এমুলেটর শুরু করুন।
- 5. OnWorks Linux OS থেকে আপনি এইমাত্র শুরু করেছেন, আমাদের ফাইল ম্যানেজারে যান https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনার পছন্দের ব্যবহারকারীর নাম সহ।
- 6. অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন, এটি ইনস্টল করুন এবং এটি চালান।
স্ক্রীনশটগুলি
Ad
লিনাক্সে অনলাইনে চালানোর জন্য হায়ারাকিক্যাল_ডিএনএকোডার
বর্ণনাঃ
বড় জিনোম ডেটার স্টোরেজ এবং ডেটা স্থানান্তর বায়োমেডিকাল গবেষকদের জন্য গুরুত্বপূর্ণ উদ্বেগ হয়ে উঠছে। আমরা একটি শ্রেণীবিন্যাস কাঠামো সহ একটি অভিনব বহু-রেফারেন্স ভিত্তিক জিনোম কম্প্রেশন পদ্ধতি উপস্থাপন করি। আমাদের পদ্ধতি ডি ফ্যাক্টো স্ট্যান্ডার্ড অ্যালাইনমেন্ট ফরম্যাটের জন্য কাজ করে (অর্থাৎ, BAM) কম্প্রেশন যা বর্তমান সময়ে প্রয়োজনীয়। আমরা SOAP3, একটি GPU-ভিত্তিক সারিবদ্ধ সফ্টওয়্যার ব্যবহার করে একটি রেফারেন্স সিকোয়েন্সে নতুন সিকোয়েন্স সারিবদ্ধ করি এবং সঠিক ম্যাপড রিডের জন্য ম্যাপিং বৈশিষ্ট্য এবং তথ্যের সারসংক্ষেপ করি। সঠিক সারিবদ্ধ হার বাড়ানোর জন্য, আমরা রেফারেন্স ক্রম পরিবর্তন করে বা পঠিত দৈর্ঘ্য ছোট করে প্রায় ম্যাপ করা এবং আনম্যাপ করা রিডগুলিকে পুনরায় সাজাই। ইতিমধ্যে, আমরা কে-মানে ক্লাস্টারিং স্কিমের মাধ্যমে "ক্ষতিকর" মানের মান ব্যবহার করে অধ্যয়নটি এগিয়ে নিয়েছি এবং ডাউনস্ট্রিম অ্যাপ্লিকেশনগুলিতে এর মিনিট প্রভাব খুঁজে পাই। প্রস্তাবিত পদ্ধতিটি 0.5 থেকে 0.65 পর্যন্ত কম্প্রেশন অনুপাত অর্জন করেছে, যা পরীক্ষামূলক ডেটাসেটে 35%-50% স্থান সাশ্রয়ের সাথে মিলে যায়।বৈশিষ্ট্য
- দক্ষ
- দ্রুত
- আশাপ্রদ
পাঠকবর্গ
তথ্য প্রযুক্তি, বিজ্ঞান/গবেষণা, প্রকৌশল
প্রোগ্রামিং ভাষা
সি ++
এটি একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/hierachicaldnac/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।