এটি HMCan নামের লিনাক্স অ্যাপ যার সর্বশেষ রিলিজটি HMCan.tar.gz হিসাবে ডাউনলোড করা যেতে পারে। এটি ওয়ার্কস্টেশনের জন্য বিনামূল্যের হোস্টিং প্রদানকারী OnWorks-এ অনলাইনে চালানো যেতে পারে।
ডাউনলোড করুন এবং অনলাইনে চালান HMCan নামের এই অ্যাপটি OnWorks সহ বিনামূল্যে।
এই অ্যাপটি চালানোর জন্য এই নির্দেশাবলী অনুসরণ করুন:
- 1. আপনার পিসিতে এই অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন৷
- 2. আমাদের ফাইল ম্যানেজারে প্রবেশ করুন https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনি যে ইউজারনেম চান।
- 3. এই ধরনের ফাইল ম্যানেজারে এই অ্যাপ্লিকেশনটি আপলোড করুন।
- 4. এই ওয়েবসাইট থেকে OnWorks Linux অনলাইন বা Windows অনলাইন এমুলেটর বা MACOS অনলাইন এমুলেটর শুরু করুন।
- 5. OnWorks Linux OS থেকে আপনি এইমাত্র শুরু করেছেন, আমাদের ফাইল ম্যানেজারে যান https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনার পছন্দের ব্যবহারকারীর নাম সহ।
- 6. অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন, এটি ইনস্টল করুন এবং এটি চালান।
HMCan
Ad
বর্ণনাঃ
HMCan হল হিডেন মার্কভ মডেল ভিত্তিক টুল যা ক্যান্সার চিপ-সিক ডেটাতে হিস্টোন পরিবর্তন সনাক্ত করতে তৈরি করা হয়েছে। এটি ডেটাতে তিনটি সংশোধন পদক্ষেপ প্রয়োগ করে: কপি নম্বর সংশোধন, GC পক্ষপাত সংশোধন এবং শব্দ স্তর সংশোধন।
HMCan চালানোর জন্য, একজনের প্রয়োজন ChIP-seq টার্গেট অ্যালাইনমেন্ট ফাইল, এবং কন্ট্রোল অ্যালাইনমেন্ট ফাইল। কিছু কনফিগারেশনও প্রয়োজন, আরও তথ্যের জন্য অনুগ্রহ করে README ফাইলটি দেখুন।
লেখকঃ হাইথাম আশুর
যোগাযোগ: ভ্যালেন্টিনা বোয়েভা ইনস্টিটিউট কুরি
হাইথাম আশুর কিং আবদুল্লাহ ইউনিভার্সিটি অফ সায়েন্স অ্যান্ড টেকনোলজি।
প্রোগ্রামিং ভাষা
সি ++
বিভাগ
এটি একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/hmcan/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।