এটি KMC-KaiC নামের একটি লিনাক্স অ্যাপ যার সর্বশেষ প্রকাশটি KMC_KaiC_Original.zip হিসাবে ডাউনলোড করা যেতে পারে। এটি ওয়ার্কস্টেশনের জন্য বিনামূল্যের হোস্টিং প্রদানকারী OnWorks-এ অনলাইনে চালানো যেতে পারে।
ডাউনলোড করুন এবং অনলাইনে চালান KMC-KaiC নামের এই অ্যাপটি OnWorks সহ বিনামূল্যে।
এই অ্যাপটি চালানোর জন্য এই নির্দেশাবলী অনুসরণ করুন:
- 1. আপনার পিসিতে এই অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন৷
- 2. আমাদের ফাইল ম্যানেজারে প্রবেশ করুন https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনি যে ইউজারনেম চান।
- 3. এই ধরনের ফাইল ম্যানেজারে এই অ্যাপ্লিকেশনটি আপলোড করুন।
- 4. এই ওয়েবসাইট থেকে OnWorks Linux অনলাইন বা Windows অনলাইন এমুলেটর বা MACOS অনলাইন এমুলেটর শুরু করুন।
- 5. OnWorks Linux OS থেকে আপনি এইমাত্র শুরু করেছেন, আমাদের ফাইল ম্যানেজারে যান https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনার পছন্দের ব্যবহারকারীর নাম সহ।
- 6. অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন, এটি ইনস্টল করুন এবং এটি চালান।
স্ক্রীনশটগুলি
Ad
KMC-KaiC
বর্ণনাঃ
এই কোডটি একটি ডেডিকেটেড কাইনেটিক মন্টে কার্লো (KMC) অ্যালগরিদম যা অনুবাদ পরবর্তী কাই সার্কাডিয়ান ঘড়ির একটি মডেলকে অনুকরণ করে।
কোডটি আপনাকে কাই সিস্টেমকে পৃথক KaiC হেক্সামার এবং মনোমারের স্তরে অনুকরণ করতে দেয় এবং প্রতিটি ATP নিউক্লিওটাইডের টার্নওভার স্পষ্টভাবে ট্র্যাক করে। এটিপি হাইড্রোলাইসিস ছাড়াও, সমস্ত প্রতিক্রিয়া বিস্তারিত ভারসাম্য মেনে চলে।
কোডের প্রয়োগটি "অনুবাদ পরবর্তী কাই সার্কাডিয়ান ঘড়ির একটি তাপগতিগতভাবে সামঞ্জস্যপূর্ণ মডেল" শিরোনামে আমাদের নিবন্ধে বর্ণনা করা হয়েছে, যা PLOS কম্পিউটেশনাল বায়োলজি ওপেন এক্সেস জার্নালে বিনামূল্যে পাওয়া যায়:
https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1005415
*আপডেট* আমরা ATP হাইড্রোলাইসিসের বিপরীত প্রতিক্রিয়া সহ আমাদের মডেলের একটি সম্পূর্ণ বিপরীত সংস্করণ তৈরি করেছি। এটি থার্মোডাইনামিক ভারসাম্য এ মডেল চালানো সম্ভব করে তোলে। মডেলটির এই সংস্করণটি KMC_KaiC_Rev.zip-এর অধীনে ডাউনলোড করা যেতে পারে।
আপনি যদি আপনার নিজের গবেষণার জন্য আমাদের মডেল ব্যবহার করতে চান, তাহলে অনুগ্রহ করে আমাদের PLOS কম্পিউটেশনাল বায়োলজি পেপারটি উল্লেখ করুন।
পাঠকবর্গ
বিজ্ঞান/গবেষণা
ব্যবহারকারী ইন্টারফেস
কমান্ড লাইন
প্রোগ্রামিং ভাষা
সি ++
বিভাগ
এটি একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/kmc-kaic/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।
