এটি হল MCPerm নামের Linux অ্যাপ: Monte Carlo SNP পারমুটেশন যার সর্বশেষ প্রকাশ MCPerm_1.1.2.tar.gz হিসাবে ডাউনলোড করা যেতে পারে। এটি ওয়ার্কস্টেশনের জন্য বিনামূল্যের হোস্টিং প্রদানকারী OnWorks-এ অনলাইনে চালানো যেতে পারে।
MCPerm নামের এই অ্যাপটি অনলাইনে ডাউনলোড করুন এবং চালান: OnWorks সহ মন্টে কার্লো SNP পারমুটেশন বিনামূল্যে।
এই অ্যাপটি চালানোর জন্য এই নির্দেশাবলী অনুসরণ করুন:
- 1. আপনার পিসিতে এই অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন৷
- 2. আমাদের ফাইল ম্যানেজারে প্রবেশ করুন https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনি যে ইউজারনেম চান।
- 3. এই ধরনের ফাইল ম্যানেজারে এই অ্যাপ্লিকেশনটি আপলোড করুন।
- 4. এই ওয়েবসাইট থেকে OnWorks Linux অনলাইন বা Windows অনলাইন এমুলেটর বা MACOS অনলাইন এমুলেটর শুরু করুন।
- 5. OnWorks Linux OS থেকে আপনি এইমাত্র শুরু করেছেন, আমাদের ফাইল ম্যানেজারে যান https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনার পছন্দের ব্যবহারকারীর নাম সহ।
- 6. অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন, এটি ইনস্টল করুন এবং এটি চালান।
MCPerm: মন্টে কার্লো SNP পারমুটেশন
Ad
বর্ণনাঃ
MCPerm: কেস-কন্ট্রোল অ্যাসোসিয়েশন স্টাডিতে একাধিক পরীক্ষার পারমিউটেশনের জন্য একটি মন্টে কার্লো পারমুটেশন পদ্ধতি
ট্র্যাডিশনাল পারমুটেশন (TradPerm) পরীক্ষা হল একটি গুরুত্বপূর্ণ নন-প্যারামেট্রিক বিশ্লেষণ পদ্ধতি যা কেস-কন্ট্রোল অ্যাসোসিয়েশন স্টাডিতে একাধিক পরীক্ষার সংশোধনের জন্য সোনার মান হিসাবে গণ্য করা যেতে পারে। যাইহোক, এটি প্রচুর পরিমাণে র্যান্ডম শাফেল সম্পাদন করতে মূল একক নিউক্লিওটাইড পলিমরফিজম (SNP) জিনোটাইপ এবং ফেনোটাইপ ডেটার উপর নির্ভর করে এবং এইভাবে এটি গণনামূলকভাবে নিবিড়, বিশেষ করে জিনোম-ওয়াইড অ্যাসোসিয়েশন স্টাডি (GWAS) এর জন্য। TradPerm p-মানের আকার পরিবর্তন না করে গণনার গতি উন্নত করতে, আমরা TradPerm-এর একটি দক্ষ বিকল্প হিসাবে একটি মন্টে কার্লো পারমুটেশন (MCPerm) পদ্ধতি তৈরি করেছি।
পদ্ধতি: MCPerm-এর আসল জিনোটাইপ এবং ফেনোটাইপ ডেটা এলোমেলো করার দরকার নেই। এটি মন্টে কার্লো পদ্ধতি ব্যবহার করে, কেস এবং নিয়ন্ত্রণে জিনোটাইপের এলোমেলো সংখ্যা (AA, Aa এবং aa) তৈরি করতে দ্বি-পদক্ষেপের হাইপারজ্যামিতিক বন্টন ব্যবহার করে।
প্রোগ্রামিং ভাষা
এস / আর
বিভাগ
এটি একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/mcperm/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।
