এটি NGSEP নামের লিনাক্স অ্যাপ যার সর্বশেষ রিলিজটি NGSEPwindows_4.3.2.zip হিসাবে ডাউনলোড করা যেতে পারে। এটি ওয়ার্কস্টেশনের জন্য বিনামূল্যের হোস্টিং প্রদানকারী OnWorks-এ অনলাইনে চালানো যেতে পারে।
NGSEP নামের এই অ্যাপটি OnWorks সহ বিনামূল্যে অনলাইনে ডাউনলোড করুন এবং চালান।
এই অ্যাপটি চালানোর জন্য এই নির্দেশাবলী অনুসরণ করুন:
- 1. আপনার পিসিতে এই অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন৷
- 2. আমাদের ফাইল ম্যানেজারে প্রবেশ করুন https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনি যে ইউজারনেম চান।
- 3. এই ধরনের ফাইল ম্যানেজারে এই অ্যাপ্লিকেশনটি আপলোড করুন।
- 4. এই ওয়েবসাইট থেকে OnWorks Linux অনলাইন বা Windows অনলাইন এমুলেটর বা MACOS অনলাইন এমুলেটর শুরু করুন।
- 5. OnWorks Linux OS থেকে আপনি এইমাত্র শুরু করেছেন, আমাদের ফাইল ম্যানেজারে যান https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনার পছন্দের ব্যবহারকারীর নাম সহ।
- 6. অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন, এটি ইনস্টল করুন এবং এটি চালান।
স্ক্রীনশটগুলি
Ad
এনজিএসইপি
বর্ণনাঃ
NGSEP হল সংক্ষিপ্ত এবং দীর্ঘ DNA উচ্চ থ্রুপুট সিকোয়েন্সিং রিড বিশ্লেষণের জন্য একটি সমন্বিত কাঠামো। বর্তমান সংস্করণটি ডি-নোভো এবং রেফারেন্স নির্দেশিত ডেটার সিকোয়েন্সিং বিশ্লেষণের জন্য কার্যকারিতা প্রদান করে, যার মধ্যে রয়েছে জিনোম সমাবেশ, রিড ম্যাপিং, ভেরিয়েন্ট সনাক্তকরণ এবং জিনোটাইপিং এবং হ্রাসকৃত উপস্থাপনা প্রোটোকল থেকে উৎপন্ন ডেটার ডি-নোভো বিশ্লেষণ। NGSEP এছাড়াও জিনোমিক ভ্যারিয়েশন ডেটাবেস (VCF ফাইল) বিশ্লেষণের জন্য মডিউল প্রদান করে, যার মধ্যে রয়েছে কার্যকরী টীকা, ফিল্টারিং, ফরম্যাট রূপান্তর, তুলনা, ক্লাস্টারিং, ইম্প্যুটেশন, ইন্ট্রোগ্রেশন বিশ্লেষণ এবং বিভিন্ন ধরনের পরিসংখ্যান। সংস্করণ 4 থেকে, আমরা জিনোম এবং ট্রান্সক্রিপ্টোমগুলির পরিচালনার জন্য কার্যকারিতা প্রদান করি, যার মধ্যে জিনোম সারিবদ্ধকরণ এবং ট্রান্সপোজেবল উপাদানগুলির টীকা রয়েছে৷ কার্যকারিতার একটি সম্পূর্ণ তালিকা আমাদের উইকিতে উপলব্ধ (https://sourceforge.net/p/ngsep/wiki/Home/).
ডাউনলোড করার আগে: সবুজ বোতামটি কমান্ড লাইন ব্যবহারের জন্য জারকে নির্দেশ করে। GUI এবং অন্যান্য বিকল্পগুলির জন্য উইকি দেখুন
বৈশিষ্ট্য
- ডি-নোভো জিনোম সমাবেশ
- রেফারেন্স জিনোমে কাঁচা পাঠের প্রান্তিককরণ
- SNPs, CNVs এবং স্ট্রাকচারাল ভেরিয়েন্ট সনাক্তকরণ
- VCF ম্যানিপুলেশন: কার্যকরী টীকা, একত্রীকরণ, ফিল্টার, তুলনা, বিন্যাস রূপান্তর, অভিযোজন
- Demultiplexing পড়ে
- টীকা জিনোম সমাবেশের প্রান্তিককরণ
- GFF3 ফরম্যাটে ট্রান্সক্রিপ্টোম অ্যানপটেশনে পরিসংখ্যান এবং ফিল্টারিং
পাঠকবর্গ
স্বাস্থ্যসেবা শিল্প, বিজ্ঞান/গবেষণা, অন্যান্য শ্রোতা, কৃষি
ব্যবহারকারী ইন্টারফেস
জাভা SWT, কনসোল/টার্মিনাল, Eclipse
প্রোগ্রামিং ভাষা
জাভা
বিভাগ
এটি এমন একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/ngsep/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।
